Kolonoskopija i endoskopija se odnose na gotovo istu vrstu zahvata, ali razlika je u dijelu tijela koji se pregledava. Kolonoskopija je jednostavno specijalizirana vrsta endoskopije. Obje su metode gledanja unutar tijela s malom cijevi koja se zove endoskop, ali kolonoskopija se posebno fokusira na pregled debelog crijeva.
I u kolonoskopiji i u endoskopiji, kruta ili fleksibilna cijev koja se koristi u postupku naziva se endoskop. Endoskop može imati kameru na kraju i neka sredstva za osvjetljavanje unutarnjih organa ili putova koje vodi cijev. Osim toga, ima ugrađeno sredstvo za prijenos slike natrag liječniku ili tehničaru koji ocjenjuje kolonoskopiju i endoskopiju.
Cilj oba zahvata je dohvatiti što više informacija uz što je moguće manje invazivnost. U mnogim slučajevima, kirurški zahvat se može izbjeći korištenjem jedne od ovih tehnika, ili postupci mogu otkriti vrijedne informacije koje nalažu da je operacija jedina opcija za izlječenje svega što boli pacijenta. U kolonoskopiji i endoskopiji postoje manji rizici. To uključuje bol na mjestu ulaska, unutarnje ili vanjske infekcije i povremene nuspojave sedacije.
U kolonoskopiji se endoskop uvodi kroz anus kako bi se pregledalo debelo crijevo i tanko crijevo. Endoskop će osvijetliti unutrašnjost tijela i omogućiti dijagnozu ulceracija ili polipa unutar debelog crijeva. Postupak također omogućuje biopsiju sumnjivih lezija u debelom crijevu. U nekim slučajevima, lezije se mogu potpuno ukloniti.
Endoskopija općenito može imati mnogo različitih primjena. Jedna od najčešćih je endoskopija gastrointestinalnog trakta (GI). Endoskopijom GI može se pregledati želudac, jednjak, dvanaesnik, tanko crijevo, debelo crijevo (kolonoskopija) i žučni kanal. Anus i rektum također se mogu povećati i pregledati endoskopom.
Dišni putovi, uši, mokraćni putovi i ženski reproduktivni sustav također su česte mete za endoskopije. Dok ste trudni, endoskop se može koristiti za pregled amniona (naziva se amnioskopija) i samog fetusa (fetoskopija). Ovi zahvati obično ne zahtijevaju nikakvu vrstu reza, ali pregled nekih organa ili zatvorenih šupljina može zahtijevati mali kirurški rez. Takav je slučaj s pregledom zdjelične ili trbušne šupljine (laparoskopija), zgloba (artroskopija) ili organa prsnog koša (medijastinoskopija ili torakoskopija).