Ako imate ozbiljnu infestaciju šišmiša, većina stručnjaka se slaže da je najbolja stvar unajmiti profesionalnu tvrtku za uklanjanje šišmiša. Ti će ljudi shvatiti gdje se šišmiši smještaju i kako ulaze i izlaze, a zatim će poduzeti mjere da šišmiši puste da odu, a da im ne dopuste povratak. Cijeli ovaj proces obično traje najviše nekoliko tjedana, a nakon što se završi, ne biste trebali imati više problema sa šišmišima. Ako pokušavate izaći na kraj s jednim šišmišom, to često možete riješiti tako da jednostavno otvorite prozore i ostavite šišmiša na miru neko vrijeme. Ponekad biste mogli pokušati uhvatiti šišmiša sa zaštitnim rukavicama i mrežom, ali to može biti opasno i vjerojatno bi bilo sigurnije pozvati kontrolu nad životinjama ako je moguće.
Jedan od glavnih razloga zašto se ljudi pokušavaju riješiti šišmiša je taj što oni mogu nositi bjesnoću i nekoliko drugih bolesti. Te stvari ponekad mogu prenijeti na ljude kroz ugrize. Napadi šišmiša nisu toliko česti i općenito je prilično rijetko da šišmiši imaju bjesnoću, ali se to ipak obično smatra vrijednim brige. Često je to dobar razlog da se pokušate riješiti šišmiša ako imate zarazu.
Mnoga područja imaju zakone koji zabranjuju ubijanje kao način da se riješite šišmiša. Često su važan dio mnogih ekosustava zbog svoje sklonosti da jedu kukce. Možda postoji nekoliko načina za ubijanje šišmiša, ali čak i izvan etičkih i pravnih pitanja, većina stručnjaka se slaže da to zapravo nije praktičan način postupanja s njima.
Obično se preporučuje traženje stručnog stručnjaka za isključenje koji će se riješiti šišmiša zbog sigurnosnih problema vezanih za rukovanje šišmišima i stručnosti potrebne za pronalaženje njihovih skrovišta. Ponekad može biti potrebno mnogo vještine da saznate kako točno šišmiši ulaze i izlaze iz zgrade, a možda ćete imati problema da to učinite sami. Također je istina da ako šišmiši treba ukloniti ručno, to može biti prilično opasno.
Glavna metoda postupanja sa šišmišima naziva se isključenje. To u osnovi uključuje korištenje preklopa ili drugih jednosmjernih uređaja za zatvaranje ulaza u vašu kuću. Šišmiši moraju izaći vani kako bi pronašli dovoljno insekata za jelo, tako da će većina njih svaku večer napuštati vaš dom kako bi se nahranili. Uređaji za isključenje puštaju šišmiše da izađu, ali im onemogućuju povratak. Prirodnim procesom eliminacije to će rezultirati domom bez šišmiša u roku od nekoliko tjedana, a možda i mnogo prije.