Liječnici uzimaju u obzir mnoge čimbenike kada određuju ispravnu dozu penicilina. Težina pacijenta, anamneza i moguće alergije na lijekove važne su stvari koje treba uzeti u obzir. Infekcija koja se liječi također će pomoći u određivanju točne količine ovog antibiotika za primjenu. Dok se penicilin koristi isključivo za liječenje bakterijskih infekcija, različite bakterije zahtijevaju različite doze. Način isporuke – oralno, injekcijom ili intravenozno – također će utjecati na količinu penicilina koji se daje pacijentu.
Težina pacijenta je primarna briga liječnika pri određivanju doze penicilina. Liječnici će propisati veću dozu za odraslu osobu ili bolesnika s većom težinom nego za manje odrasle osobe ili djecu. Djeca obrađuju i komuniciraju s drogom drugačije od odraslih, a vrlo mala djeca će eliminirati drogu iz svog tijela sporije od starije djece i odraslih. Liječnik će u skladu s tim smanjiti dozu kada djetetu daje penicilin.
Drugi lijekovi koje pacijent uzima također mogu utjecati na to kako liječnik određuje ispravnu dozu penicilina. Različiti lijekovi mogu međusobno djelovati, mijenjajući način na koji svaki lijek utječe na pacijenta i utječući na učinak svakog lijeka. Penicilin, na primjer, može učiniti kontracepcijske pilule manje učinkovitima.
Alergije na penicilin ili druge lijekove mogu utjecati na to koliko penicilina će liječnik dati pacijentu. Sama alergija na penicilin spriječit će liječnika da uopće prepiše penicilin. Ako pacijent ima alergiju na cefalosporine, koji su druga vrsta antibiotika, liječnik može smanjiti dozu penicilina kako bi izbjegao reakciju ili može uopće izbjeći propisivanje penicilina.
Zdravstvena stanja, prošla ili sadašnja, koja nisu povezana sa stanjem koje se liječi penicilinom, također mogu utjecati na liječničku odluku u vezi s dozom penicilina. Određeni zdravstveni problemi kao što su astma, bolest bubrega, poremećaji krvarenja ili bilo koja alergija mogu zahtijevati smanjenje doze. Liječnik također može naručiti posebne testove, pod tim okolnostima, kako bi utvrdio sigurnost određene doze.
Infekcija koja se liječi bit će posljednji čimbenik koji liječnik uzima u obzir pri određivanju doze penicilina. Penicilin se koristi za liječenje širokog spektra bakterijskih infekcija. Svaki od njih ima osnovnu dozu, temeljenu na dugogodišnjoj medicinskoj povijesti i studijama slučaja, za pacijenta određene težine. Liječnici imaju specijalizirano znanje o ovim infekcijama i o tome koliko je penicilina potrebno za njihovo liječenje.