U osnovi postoje dva načina za uklanjanje dupliciranih datoteka: ručno i automatski. Ručno uklanjanje dupliciranih datoteka uključuje traženje i brisanje datoteka jednu po jednu. Automatsko uklanjanje izvodi se softverskim programom za pronalaženje duplikata koji većina operacijskih sustava nema unaprijed instaliran. Ponekad, umjesto automatskog brisanja svih duplikata, alati za pronalaženje duplikata omogućuju korisniku da odabere koje će datoteke ukloniti, čineći proces automatskim i ručnim. Mnogi pretraživači dupliciranih datoteka su reklamni programi koji podržavaju oglašavanje, što znači da instalacija programa može dovesti do neželjenih skočnih prozora ili čestih zahtjeva za kupnjom programa u cijelosti.
Ako postoji nekoliko datoteka za brisanje, vjerojatno neće trebati dugo za ručno uklanjanje dupliciranih datoteka. Kada koristite Microsoft® operativni sustav, jednostavno povucite datoteku u koš za smeće da biste je privremeno uklonili. Ako ste sigurni da je datoteka duplikat koji se mora izbrisati, odaberite opciju Isprazni koš za smeće pod Datoteka da biste trajno izbrisali njezin sadržaj. Kada koristite Mac OS® računalo, proces je sličan, ali postoji ikona kante za smeće umjesto koša za smeće. Bez obzira koji se operativni sustav koristi, privremeno izbrisana datoteka obično se može oporaviti ako smeće ili koš za smeće nisu ispražnjeni.
Da biste automatski uklonili duplicirane datoteke, preuzmite i instalirajte renomirani alat za traženje duplikata. Postoji mnoštvo ovih dostupnih programa, posebno za Windows® operacijske sustave. Pokretanje programa skenirat će vaše računalo za duple datoteke. Ovisno o složenosti programa, tražit će od vas da izbrišete sve duplikate ili vam dopustiti da odaberete koje ćete zadržati prije nego što uklonite ostale. Ovo je najbrži način da pronađete i izbrišete mnogo duplikata, ali postoje neki nedostaci; na primjer, program može biti softver koji podržava oglašavanje ili se mora kupiti prije brisanja duplikata.
Kada tražite alat za traženje datoteka koji će ukloniti duplicirane datoteke, razmislite o odabiru onoga koji je dobro pregledan, pogotovo ako ste ga odlučili kupiti. Također provjerite je li program kompatibilan s operativnim sustavom koji koristite prije nego što ga preuzmete. Ako ste odlučili kupiti alat za traženje dupliciranih datoteka, isprobajte ga prije kupnje kako ne biste zaglavili s programom koji ne smatrate korisnim. Dok neki programi dolaze s jamstvom povrata novca od 14 do 30 dana, ne rade svi niti su to zakonski obvezni. Također biste mogli ispisati račun u slučaju da se program kasnije mora ponovno preuzeti.