Prilikom odabira sira fontina kupac treba obratiti pažnju na sve kvalitete sira. Sir treba vizualno pregledati kako bi se uvjerili da je boja ujednačena i da nema plijesni. Rukovanje sirom može pomoći da se utvrdi je li ravnomjerno sazrio. Sir treba po mogućnosti pomirisati i kušati prije kupnje jer se kvaliteta sira fontina uglavnom temelji na njegovom okusu.
Kupac prije kupnje treba provjeriti izgled sira. Sir Fontina je obično svijetložute ili krem boje u sredini, s izraženijom žutom bojom prema kori, koja je obično srednje nijanse narančasto-smeđe boje. Na siru ne smije biti plavih ili zelenih mrlja koje bi upućivale na plijesan. Male rupe u siru mogu se zanemariti jer se one obično stvaraju jer mjehurići zraka ostaju zarobljeni u siru koji fermentira.
Tekstura je još jedan važan faktor pri odabiru sira fontina. Najmekša fontina bi trebala dati kada se stisne, ali ne smije biti toliko mekana da se raspada. U svom najčvršćem obliku, fontina će biti kruta na dodir, iako obično ne tako čvrsta kao suhi jack ili parmezan. Tekstura sira treba biti slična, bez mekih ili tvrdih mrlja.
Prilikom odabira sira treba uzeti u obzir i miris sira. Uglavnom, mladi sir fontina, koji je još mekan, ima blag miris, ali ne smije biti previše oštar. Stariji sir može imati izražen miris. Sir Fontina će sazrijeti ako se ostavi na sobnoj temperaturi, zbog čega će miris pojačati intenzitet.
Konačno, najvažniji čimbenik u odabiru sira fontina je okus sira. Kad god je moguće, sir treba kušati prije kupnje, što je uobičajena praksa u buticima sira, pa čak i u nekim modernim trgovinama. Mlađi sir je lagan i kremast, ali odležana fontina ima orašastiji, složeniji okus. Prvim kušanjem sira kupac se može uvjeriti da kupuje sir u kojem će uživati. Osoba treba odabrati sir fontina koji će imati onu vrstu okusa koji će najbolje nadopuniti željenu upotrebu.