Odabir najbolje mikrovalne pećnice ovisi o tome čemu mikrovalna pećnica služi, gdje će biti postavljena i koliko je netko spreman potrošiti. Općenito govoreći, svaka mikrovalna pećnica koja nije pokvarena može ispuniti svrhu mikrovalne pećnice, ali neki modeli imaju više značajki i mogu biti moćniji. Važno je razmisliti o tome bi li poželjniji radna ploča ili ugradbeni model i treba li mikrovalna pećnica biti nova ili ne. Za osobe koje kuhaju velike količine u mikrovalnoj pećnici, odabir stroja koji se može prilagoditi vrlo specifičnim uputama za kuhanje može biti najbolji izbor, ali za ljude koji mikrovalnu pećnicu prvenstveno koriste za osnovne funkcije, to obično nije potrebno.
Prva stvar koju treba uzeti u obzir pri odabiru najbolje mikrovalne pećnice je koji će se stil mikrovalne pećnice kupiti. Postoje dvije glavne vrste mikrovalnih pećnica, a svaka ima određene prednosti. Mikrovalna pećnica na radnom stolu može biti najbolja mikrovalna pećnica ako se iznajmljuje ili se može preseliti u budućnosti. S druge strane, ugrađena mikrovalna pećnica obično se postavlja iznad štednjaka i može uštedjeti prostor na pultu.
Ljudi koji često kuhaju koristeći ovu vrstu pećnice mogu otkriti da je najbolja mikrovalna pećnica s mnogo različitih postavki. Mogućnost mijenjanja snage mikrovalne pećnice iznimno je vrijedna pri kuhanju određenih jela, ali mnogi ljudi se snalaze i bez ove značajke. Postavke za odmrzavanje, određene vrste hrane, pa čak i rotaciju mogu biti korisne osobama koje redovito kuhaju hranu u mikrovalnoj pećnici. Veličina mikrovalne pećnice također je važan faktor, jer male mikrovalne pećnice ne mogu primiti neka velika posuđa. Za ljude koji prvenstveno zagrijavaju kokice, smrznute obroke ili druge jednostavne namirnice, dodatni trošak ovih značajki vjerojatno nije potreban.
Proračun je svakako faktor pri odabiru najbolje mikrovalne pećnice, ali ponekad je moguće kupiti bolju mikrovalnu pećnicu nego što bi si inače mogla priuštiti kupnjom korištenog stroja. Ovo je dobro rješenje za mnoge ljude, ali mikrovalne pećnice se pokvare, a odabir rabljenog modela može biti razočaranje. Nova mikrovalna pećnica će zajamčeno raditi, a možda čak dolazi i s jamstvom. Koji je izbor najbolji ovisi o rizicima koje je potrošač spreman preuzeti.
Većina ljudi izgled mikrovalne pećnice ne smatra primarnim razmatranjem, no budući da će ovaj predmet najvjerojatnije biti vidljiv u nečijoj kuhinji, dobro je barem razmisliti kako će izgledati. Većina mikrovalnih pećnica je bijela ili crna, ali postoje i modeli od nehrđajućeg čelika ili u boji. Tu su i retro mikrovalne pećnice, koje mogu biti autentični vintage predmeti ili mogu jednostavno imati retro detalje.