U financijama se višestruka diskriminantna analiza (MDA) koristi za razvrstavanje vrijednosnih papira u povezane skupine radi daljnje analize. Ova statistička tehnika komprimira varijansu ili udaljenost skupa podataka od srednje vrijednosti uz očuvanje značajnih informacija koje se mogu ispitati drugim metodama. Na primjer, višestruka diskriminantna analiza može se primijeniti na niz vrijednosnih papira kako bi se utvrdilo članstvo u upravljanom broju povezanih grupa. Ponašanje između ovih skupina može se zatim ispitati drugim statističkim metodama.
Prilikom odabira pojedinog vrijednosnog papira ili sastavljanja portfelja moguće je provesti niz analiza. Točnost analize može biti narušena kada postoji nekoliko varijabli koje treba uzeti u obzir istovremeno. Koristeći višestruku diskriminantnu analizu, raspon podataka može se konsolidirati u tri ili više skupina povezanih s jednim ili više varijabilnih čimbenika. Elementi oko kojih su skupine formirane učinkovito su eliminirani iz razmatranja, dok su ostali odnosi podataka sačuvani.
Skup vrijednosnih papira MDA može podijeliti u nekoliko grupa prema pravilu cijene koje analitičar definira kao značajnu. Ponašanje tih skupina moglo bi se zatim ispitati u odnosu na druge čimbenike, kao što je povijesni učinak, bez potrebe da se cijena uzme u obzir kao varijabla. Može se ispitati nekoliko varijabilnih čimbenika i ispitati međusobna djelovanja između povezanih skupina. Često je cilj takve analize stvoriti Markowitz učinkovit portfelj.
Prema teoriji, Markowitz učinkovit portfelj je onaj koji ostvaruje najvišu razinu povrata za dani iznos rizika. Daljnji napori za smanjenje rizika rezultirali bi padom prinosa; pokušaji povećanja prinosa povlačili bi za sobom nerazmjerno povećanje rizika. Za ostvarenje ovog cilja neophodna je analiza portfelja u cjelini, a ne performansi pojedinih vrijednosnih papira. Višestruka diskriminantna analiza važan je alat u implementaciji ove vrste statistički utemeljene teorije portfelja.
Drugi model koji u velikoj mjeri koristi višestruku diskriminantnu analizu je Altman Z-Score. Ovo je formula za predviđanje izgleda da će tvrtka u bliskoj budućnosti bankrotirati. Z-score se temelji na analizi pet različitih financijskih odnosa. Svaki jedinstveni omjer pruža drugačiji uvid u financijsko zdravlje tvrtke. Kombinirana analiza ovih omjera i rezultirajućeg Z-scorea pokazala se 72% točnom u predviđanju bankrota poduzeća dvije godine prije podnošenja zahtjeva za zaštitu.