Minnesota je jedna od najsjevernijih država srednjeg zapada SAD-a. Prihvaćena je kao 32. država 1858. Iako je Minnesota usvojila državni pečat 1861., nije postojala državna zastava Minnesote sve do 1893. Čini se da je poticaj za stvaranje državne zastave bila nadolazeća Svjetska kolumbijska izložba 1893., koja je bila koji će se održati u Chicagu, Illinois, u SAD-u. Sve američke države, kojih je tada bilo samo 44, zamoljene su da predstave i izlože svoju državu na izložbi, a Minnesota se našla bez državne zastave.
Komisiju je imenovalo zakonodavno tijelo Minnesote, koje je sponzoriralo natječaj za dizajn zastave otvoren za stanovnike države. Pobjedničku prijavu poslala je stanovnica Minneapolisa Amelia Hyde Center, a koristio je državni pečat kao središnji amblem zastave. Hydeov dizajn zastave uključivao je različite boje — plavu i bijelu &mddash; na svakoj strani.
Pečat države Minnesota prikazuje farmera kako ore svoju njivu, koja se nalazi u blizini potoka i malog vodopada. U blizini je otvoreno zeleno polje, a sunce izlazi na brežuljcima i drveću u daljini. Farmerova puška naslonjena je na panj iza njega. Gleda kako Indijanac jaše držeći koplje i gleda ga. Na vrpci u pečatu piše “L’Étoile Du Nord”, što na francuskom znači “Zvijezda Sjevernjača”.
U prvoj državnoj zastavi Minnesote oko pečata su bila tri važna povijesna datuma: 1819., 1858. i 1893. 1819. osnovana je tvrđava Snelling, važna vojna postaja za zaštitu novih doseljenika. Godina 1858. označava prijem Minnesote u državu, a 1893. godina dizajna zastave.
Pečat je uvijen bijelim cvjetovima mokasina na plavom polju. Dvije vrpce teku ispod pečata i uokviruju naziv države. Oko pečata 19 zvijezda u malim nakupinama tvore pet točaka veće zvijezde. Najveća zvijezda na zastavi predstavlja Minnesotu. Dizajn zastave ušile su na svilu dvije norveške imigrantske sestre, Thomane i Pauline Fjelde, a državna zastava Minnesote na izložbi je dobila zlatnu medalju za vez.
Izvorni dizajn Centra doživio je neke promjene. Godine 1957. zakonodavno tijelo promijenilo je državnu zastavu Minnesote u jednostranu, uglavnom temeljenu na proizvodnji i troškovima. Parlament Južne Dakote donio je sličnu odluku u vezi s dvostranom zastavom svoje države 1963. iz gotovo istih razloga. Tijekom promjena 1957., ružičasti i bijeli cvjetovi ženskih papuča, porijeklom iz Minnesote, zamijenili su bijele cvjetove mokasina u vijencu koji okružuje državni pečat.