Državna zastava Sjeverne Karoline kako se trenutno vijori usvojena je u ožujku 1885. General Johnston Jones je zaslužan za predlaganje zakona koji je promijenio državnu zastavu Sjeverne Karoline u odnosu na njen prethodni dizajn, koji je predstavljao Sjevernu Karolinu tijekom građanskog rata. Trenutna zastava Sjeverne Karoline prikazuje široku, vodoravnu crvenu gornju traku, iznad široke, vodoravne bijele donje trake. Okomita plava traka ukrašava lijevu stranu zastave, a iznad ove trake su zlatna slova NC, odvojena bijelom zvijezdom. Iznad ovih slova crnim slovima zlatni transparent proglašava datum Mecklenburške deklaracije o neovisnosti, 20. svibnja 1775. godine. Sličan banner ispod slova NC prikazuje datum Halifax Resolves, 12. travnja 1776.
Vjeruje se da je prva osoba koja je predložila usvajanje državne zastave Sjeverne Karoline bio pukovnik John D. Whitford. Navodi se da je svoj prijedlog iznio 20. svibnja 1861., na dan kada je Sjeverna Karolina glasovala za odcjepljenje od Sjedinjenih Američkih Država i pridruživanje Konfederativnim Državama Amerike. Dok je Konvencija Sjeverne Karoline odobrila Whitfordov prijedlog zastave, grupa je na kraju odbila njegov dizajn. Umjesto toga prihvatili su dizajn koji je stvorio William Jarl Browne. Ovaj je dizajn službeno usvojen Konvencijom Sjeverne Karoline 22. lipnja 1861. i ostao je u upotrebi do nakon građanskog rata.
Izvorna državna zastava Sjeverne Karoline po dizajnu je vrlo slična sadašnjoj državnoj zastavi Sjeverne Karoline. Položaj crvene i plave trake kako se pojavljuju na modernoj zastavi države je obrnut. Vertikalna traka s lijeve strane bila je crvena, a vodoravna gornja traka s desne strane bila je plava. Crvena okomita traka obično je nosila bijelu zvijezdu.
Iznad ove zvijezde općenito je bio napisan datum Mecklenburške deklaracije o neovisnosti, a ispod nje općenito je bio napisan datum službene sukcesije Sjeverne Karoline od Sjedinjenih Država, 20. svibnja 1861. Povjesničari vjeruju da je Sjeverna Karolina bila jedna od samo dvije konfederativne države koje su izdavati službene državne zastave svojim pukovnijama tijekom Američkog građanskog rata.
Većina vjeruje da je potreba za novom državnom zastavom Sjeverne Karoline postala jasna kada se Sjeverna Karolina ponovno pridružila Sjedinjenim Državama nakon Američkog građanskog rata. Država Sjeverna Karolina nastavlja koristiti osnovni dizajn zastave usvojen u ožujku 1885. Zakonom državnog zakonodavstva iz 1991. produljena je državna zastava Sjeverne Karoline i uklonjeni zarezi iz datuma prikazanih na njoj.