Struktura mokraćnog sustava ista je i kod muškaraca i kod žena, iako se pojedine komponente neznatno razlikuju među spolovima. Sustav filtrira tekući otpad iz krvi koji se oslobađa kao urin. Urin zdravih osoba obično je sterilan; iako sadrži otpadne tvari iz tijela, ne sadrži ništa otrovno ili bilo kakve strane materijale, poput bakterija, virusa ili gljivica. Budući da je urin sterilan, “savjet za preživljavanje” koji se može popiti zapravo vrijedi za zdrave osobe, ali budući da sadrži stanične otpadne produkte, još uvijek nije dobar za tijelo.
Gotovo sav važan posao mokraćnog sustava obavljaju bubrezi. Nefroni, koji su trgovačke strukture u bubrezima, odgovorni su za filtriranje otpadnih tvari iz krvi. One sadrže mrežu krvnih žila s velikom površinom, tako da otpad i višak soli mogu proći iz krvi za odlaganje. Uklanjanje viška soli zajedno sa staničnim otpadom omogućuje vrlo pomno praćenje sastava krvi. Struktura mokraćnog sustava optimizira ovaj proces tako da se sve nepovoljne promjene mogu brzo ispraviti.
Iz bubrega urin teče u mokraćovode, tanke cijevi koje nose mokraću do mokraćnog mjehura. Iz svakog bubrega proteže se po jedan ureter i nikada se ne križaju niti međusobno djeluju. Mišići u stijenkama mokraćovoda potiskuju mokraću prema dolje do mjehura, pa se kretanje može nastaviti čak i dok ležite. Mišići se stežu i opuštaju u procesu sličnom onom u kojem se hrana gura prema dolje u želudac, odlažući male količine urina u mjehur svakih nekoliko sekundi. Ako se to kretanje poremeti, može se poremetiti i cijeli mokraćni sustav, a može doći do infekcije bubrega ili bubrežnih kamenaca.
Urin se pohranjuje u mokraćnom mjehuru sve dok se ne mora osloboditi kako bi se napravilo mjesto za više. Dva mišićna prstena nazvana sfinkteri stežu se na otvoru mokraćnog mjehura kako bi ga držali zatvorenim dok se njegov sadržaj ne može isprazniti kroz mokraćnu cijev. Struktura mokraćnog sustava izgrađena je tako da sadrži što više urina, što je duže moguće. Budući da se mokraćni mjehur može rastegnuti, struktura mokraćnog sustava je donekle fleksibilna, ali je izgrađena za relativno kontinuiranu obradu otpada, pa sprječavanje pražnjenja mjehura može na kraju uzrokovati probleme s praćenjem krvi.