Antibiotici i proljev imaju brojne veze. Na primjer, proljev je uobičajena nuspojava mnogih antibiotskih lijekova. Liječenje antibioticima također može uzrokovati proljev povezan s antibioticima, što je bolest koja je posljedica smrti normalnih gastrointestinalnih bakterija. Dodatno, različiti infektivni uzroci proljeva mogu se liječiti antibiotskim lijekovima.
Mnogi antibiotski lijekovi uzrokuju proljev kao nuspojavu. Makrolidna klasa antibiotika, koja uključuje lijekove klaritromicin, azitromicin i eritromicin, obično uzrokuje proljev. Lijekovi tetraciklina uključujući tetraciklin, demeklociklin i minociklin također mogu uzrokovati proljev. Gastrointestinalni problemi u rasponu od mučnine do proljeva često se mogu vidjeti kod cefalosporinskih antibiotika, uključujući cefaleksin, cefepim i ceftriakson.
Proljev povezan s antibioticima još je jedna poveznica između antibiotika i proljeva. Ovo je stanje koje se razvija nakon početka antibiotske terapije za liječenje infekcije. Uz ubijanje bakterija koje uzrokuju infekciju, antibiotik ubija mnoge bezopasne bakterijske vrste koje žive u gastrointestinalnom traktu. Kao rezultat toga, pacijenti su osjetljivi na infekciju bakterijom Clostridium difficile (C. diff), što rezultira proljevom. Ova bolest poznata je pod nazivima proljev povezan s antibioticima, pseudomembranozni kolitis i proljev povezan s C. diff.
Iako se može činiti kontraintuitivnim, proljev povezan s antibioticima liječi se antibioticima. Najprije se, međutim, zaustavlja antibiotik koji je u početku izazvao proljev povezan s antibiotikom. Jednostavni slučajevi se tada mogu liječiti antibiotikom metonidazolom. Teži slučajevi mogu zahtijevati liječenje vankomicinom, jačim antibiotikom. Neki liječnici također koriste probiotičke agense kod pacijenata s proljevom povezanim s antibioticima kako bi ponovno naselili svoj gastrointestinalni trakt korisnim vrstama bakterija.
Jedno pitanje koje se može pojaviti kada se razmatraju antibiotici i proljev, osobito ako proljev počinje nakon početka liječenja antibiotikom, jest je li proljev nuspojava ili je proljev povezan s antibioticima. Za utvrđivanje uzroka važan je slijed događaja. Proljev koji je nuspojava lijeka obično počinje ubrzo nakon početka uzimanja antibiotika. Nasuprot tome, proljev povezan s antibioticima obično ne počinje prije jednog do dva tjedna nakon početka uzimanja antibiotika. Ako postoji zabuna, proljev povezan s antibioticima može se potvrditi traženjem toksina C. diff u stolici.
Druga veza između antibiotika i proljeva je da proljev može biti uzrokovan infekcijom za koju se lijekovi koriste. Putnički proljev, na primjer, obično uzrokuje bakterija Escherichia coli; brojni antibiotici dobro djeluju na iskorijenjivanje infekcije i zaustavljanje proljeva. Proljev uzrokovan bakterijskim vrstama Yersinia enterocolitica, Listeria monocytogenes i Salmonella enteriditis često reagira na antibiotike.