Bakterije salmonele su skupina mikroba koji mogu uzrokovati ozbiljno trovanje hranom. Ubija ih toplina i stoga su veća opasnost u sirovoj hrani. Hrskave klice graha, klice lucerne ili bilo koji drugi oblik klica obično se mogu poslužiti sirove umjesto kuhane. Klice i salmonela povezuju se s problemima kao što je gnoj od zaraženih životinja na usjevima ili od kontaminiranih strojeva koji se koriste za obradu usjeva.
Klice i salmonela usko su povezane u mnogim zemljama diljem svijeta, gdje god se klice bilo koje biljke konzumiraju sirove. Primjeri klica koje se povezuju s trovanjem hranom salmonelom uključuju klice lucerne, mungo graha i rotkvice. Ove mlade biljke uzgajaju se iz sjemena na uzgajalištima.
U mnogim slučajevima, samo sjeme je kontaminirano bakterijom salmonele. Ovo sjeme je moglo biti kontaminirano životinjskim ili ptičjim izmetom. Poljoprivredni strojevi koji obrađuju sjeme također mogu biti kontaminirani. Stajnjak koji se koristi za gnojidbu usjeva ili voda za navodnjavanje koja sadrži bakterije također može odložiti salmonelu na sjemenke.
Postupci koji ubijaju bilo kakvu kontaminaciju sjemena dostupni su poljoprivrednicima koji klijaju, ali mogu biti pretjerano skupi za male farme. Te tehnike uključuju kupanje sjemena u otopini kalcijevog hipoklorita ili zračenje sjemena. Organske farme također mogu odbaciti tehnike kao suprotne organskom etosu.
Poljoprivredna gospodarstva koja klijaju uglavnom uzgajaju sjeme u zatvorenim prostorima koji se drže na toplim temperaturama s visokom vlagom. Ovi uvjeti su vrlo pogodni za rast klica i bakterija salmonele. Salmonela inficira ljude i druge životinje i stoga radije raste na tjelesnoj temperaturi iu uvjetima visoke dostupnosti vode, kakvi postoje u ljudskom tijelu. Čak i ako sjemenke izvorno imaju nisku kontaminaciju bakterijama, one mogu rasti i razmnožavati se do opasnih razina tijekom procesa nicanja.
Američka uprava za hranu i lijekove preporučuje da određene skupine ljudi izbjegavaju jesti sirove klice zbog rizika od infekcije. Osjetljive osobe su starije osobe, trudnice, djeca i oni koji imaju problema s imunološkim sustavom. Kuhanje klica jedini je konačan način uklanjanja rizika od infekcije, iako neki ljudi možda radije jedu sirove ili lagano kuhane klice zbog hrskave teksture.
Osim veze između klica i salmonele, sirove klice također mogu sadržavati bakterije potencijalnog trovanja hranom E. coli i Listeria monocytogenes. Iako su klice jedan od potencijalnih izvora trovanja hranom, nisu jedini izvor. Svaka hrana koja može doći u kontakt sa kontaminiranim fekalnim tvarima, kao što je gnoj, a zatim se ne kuha, potencijalni je izvor bolesti.