Anatomija mokraćnog mjehura je dizajnirana tako da može zadržati dovoljno mokraće da pojedinac treba samo sebe osloboditi četiri do šest puta svaki dan. Nalazi se u zdjeličnoj šupljini, u blizini tankog crijeva i reproduktivnih organa. Približno veličine i oblika limuna, površina mjehura omogućuje da se organ rasteže dok se puni.
Mjehur je s bubrezima povezan cijevima zvanim ureteri, koji se spajaju s mjehurom na otvorima mokraćovoda. Ove cjevčice ulaze u mjehur kroz vrh s lijeve i desne strane, te prolaze urin u mjehur, gdje se čuva do eliminacije. Tijekom procesa eliminacije, urin izlazi iz mokraćnog mjehura kroz strukturu na dnu, zvanu uretra. U središnjoj točki između ova tri otvora nalazi se blijeda, trokutasta regija poznata kao trigonum vesicae, koju prvenstveno koriste medicinski stručnjaci kao referentnu točku za druge dijelove anatomije mokraćnog mjehura.
Nekoliko slojeva tkiva i mišića čine površinski dio anatomije mokraćnog mjehura. Najudaljeniji sloj naziva se seroza ili peritoneum. Ovo tanko tkivo slično je tkivima koje oblažu površine drugih organa u trbuhu, kao što su bubrezi i unutrašnjost samog trbuha. Ispod ovog tankog sloja tkiva nalazi se sloj koji uključuje mišiće koji nehotice kontroliraju širenje i kontrakciju mjehura. Ovaj sloj, nazvan mišić detruzora, radi nenamjerno da se širi kako urin otječe iz mokraćovoda, i da se skuplja dok se eliminira iz tijela.
S unutarnje strane mjehura je sluznica koja ima elastične kvalitete i stvara nabore kada je mjehur prazan. Pričvršćen je na vanjski mišićni sloj strukturom koja se naziva submukozni sloj. Ovaj sloj dijeli istu elastičnost kao i ostali slojevi mjehura.
Mišić koji drži mokraću u mokraćnom mjehuru poznat je kao unutarnji uretralni sfinkter. Upravo se taj ventil otvara tijekom procesa eliminacije kako bi omogućio prolaz mokraći. Kod nekih osoba inkontinencija je uzrokovana kvarom ovog ventila.
Anatomija mokraćnog mjehura jednostavna je struktura koja djeluje uglavnom nenamjerno kako bi omogućila pojedincu da čeka satima između eliminacije urina iz tijela. Osnovna anatomija mokraćnog mjehura je ista kod muškaraca i žena, a glavna razlika je duljina uretre. Veličina i oblik mokraćnog mjehura mogu se mijenjati kako pojedinac stari i može se manje zadržati što osoba stari.