Ključna razlika između e-trgovine i e-poslovanja je činjenica da je e-trgovina dio šireg svijeta e-poslovanja i obuhvaća samo vanjske aspekte elektroničkog poslovanja. Ovi vanjski procesi uključuju sve aspekte e-poslovanja koji utječu na kupce, dobavljače i periferne partnere. Šire razgraničenje e-poslovanja uključuje ove vanjske procese kao i one unutarnje. Primjeri internih procedura uključuju financije, kontrolu zaliha, proizvodne procese, ljudske resurse i web razvoj.
Na vrlo osnovnoj razini, elektronička trgovina znači razmjenu novca za robu ili usluge putem elektroničkih mreža. No, dok stvarna prodaja spada u kategoriju e-trgovine, posao edukacije, zadržavanja i privlačenja novih kupaca smatra se e-poslovanjem. E-trgovina je sastavni dio cjelokupne strategije e-poslovanja, ali je samo jedna značajka plana e-poslovanja.
Postoji nekoliko elemenata e-trgovine i e-poslovanja koji ih međusobno značajno razlikuju; iako, kada rade zajedno, jedno izravno utječe na rezultate drugog. E-trgovina se koncentrira samo na one dijelove e-poslovanja s kojima će potrošač, dobavljač ili vanjski partner komunicirati. Služba za korisnike, prodaja, primanje i isporuka narudžbi, komercijalne web aplikacije i nabava proizvodnog materijala i uredskog materijala procesi su okrenuti prema van i stoga se klasificiraju kao e-trgovina.
Za manje tvrtke ili tvrtke u početnoj fazi, razlika između e-trgovine i e-poslovanja možda neće biti od velike zabrinutosti. Uostalom, cilj novog poslovanja je generirati interes i prodati proizvode ili usluge. Ali kako tvrtka raste, tako raste i perspektiva tvrtke. Pitanja kao što su zadržavanje kupaca, upravljanje zalihama i marketinške strategije postaju najvažniji za kontinuirani uspjeh poslovanja. U velikoj tvrtki, fokus se okreće ovim aspektima iza kulisa, stvarajući veći model e-poslovanja; ako se tvrtka ne uspije koncentrirati na ove aspekte, budućnost poslovanja mogla bi biti ugrožena.
Izrada strategije elektroničkog poslovanja naglašava razlike između e-trgovine i e-poslovanja. Taj širi opseg često znači reorganizaciju cijelog poslovanja. Određivanje pravog vremena za poduzimanje takve strukturne transformacije ključno je za njezin uspjeh. Donijet će se nove perspektive, odgovornosti unutar poslovanja će se promijeniti, a temeljitije razumijevanje tehnologija elektroničkih mreža naučit će se.
Stručnjaci za internetski marketing i poslovni stručnjaci obično se slažu da je e-poslovni plan sa solidnom podjelom e-trgovine od vitalnog značaja za dugovječnost poslovanja. Čak je i vladama savjetovano da se uključe u igru e-poslovanja. Sveukupni vladin plan naziva se strategija e-javne usluge, u kojoj e-trgovina igra ulogu.