Fagot i oboa su drveni puhački instrumenti s dvostrukom trskom, ali imaju nekoliko značajnih razlika koje ih međusobno razlikuju. Nekoliko razlika koje su odmah vidljive kada se pogledaju dva instrumenta uključuju njihovu veličinu, oblik i položaj usnika. Fagot i oboa također imaju različite zvukove, pri čemu fagot svira u puno nižem registru od oboe. Iako su studentske inačice oba instrumenta često izrađene od izdržljive plastične smole, kvalitetniji modeli za iskusne glazbenike izrađeni su od različitih vrsta drva. Sustavi tipki također su vrlo različiti između ta dva instrumenta, zajedno s načinom na koji se drže.
Kada se promatraju jedno uz drugo, odmah je vidljivo nekoliko razlika između fagota i oboe. Opći izgled svakog instrumenta je osebujan. Fagot je mnogo veći od oboe i napravljen je od otprilike 7 do 8 stopa (približno 2.13 do 2.44 metra) cijevi koje su savijene u neravnom obliku slova U. Kraća, uža strana je mjesto gdje je kukast nastavak za usta pričvršćen otprilike do polovice duljine instrumenta; drugi kraj je mnogo širi i proteže se dalje od usnika. Oboa je izgrađena od jedne, ravne cijevi koja se širi u obliku blagog zvona na dnu, a ima usnik i trsku pričvršćenu na vrhu.
I fagot i oboa proizvode zvuk kada glazbenik puše zrak u dvostruku trsku, uzrokujući vibracije koje rezoniraju unutar cijevi. Svaki instrument ima specifičan zvuk i raspon. Fagot može svirati u vrlo niskom registru, s najnižim zvukom iz obitelji drvenih puhačkih instrumenata osim većeg kontrafagota. Oboa je sposobna svirati više note, a njen zvuk se uspoređuje s zvukom patke, s vrlo jasnim tonom koji je lako razlikovati među ostalim instrumentima u orkestru. Oba instrumenta su poznata po svojoj izražajnosti.
Studentske verzije oba instrumenta obično su izrađene od plastične smole jer je izdržljiva. Kvalitetniji instrument obično biraju iskusniji glazbenici. Fagot i oboa se obično izrađuju od različitih vrsta drva. Fagot je često izrađen od javora, iako se može izraditi i od drugih vrsta drva srednje tvrdoće. Oboa je najčešće izrađena od drveta poznatog kao afričko crno drvo ili grenadila.
Svaki instrument ima drugačiji sustav tipki. Tipke se koriste zajedno s prstima za pokrivanje rupa u cijevi instrumenta za stvaranje specifičnih nota. Fagot ima manje tipki, dok oboa ima relativno velik broj s otprilike 45 složenih komada tipki.
Fagot i oboa se također drže drugačije. Zbog svoje veličine, fagot se drži sa strane glazbenika, često s dodatnom potporom poput stolice ili remena za vrat. Glazbenik obično može držati obou ispred svog tijela jer je mnogo manja.