Računalno inženjerstvo i informatika imaju mnogo karakteristika koje se preklapaju, ali glavna razlika je u načinu na koji se stečene vještine koriste. Dok se računalni inženjering više usredotočuje na hardver i elektroniku, informatika se usredotočuje na računalno programiranje i dizajn softvera. Oba područja uključuju proučavanje napredne matematike, fizike i programiranja, ali je vjerojatnije da će računalni inženjeri koristiti te vještine za izgradnju hardvera nego za izradu programa. Računalni znanstvenici stoga koriste svoje znanje kako bi razumjeli kako programi i operacijski sustavi rade i kako stvoriti bolja softverska rješenja za hardver.
Studenti studijskih programa računalnog inženjerstva i informatike pohađaju nekoliko kolegija koji se preklapaju između programa. Oba programa obično zahtijevaju višestruki račun, linearnu algebru, fiziku, arhitekturu računala, umrežavanje i satove programiranja. Glavna razlika je u tome što studenti informatike pohađaju mnogo više sati iz dizajna softvera, algoritama podataka i operacijskih sustava nego studenti računalnog inženjerstva. Studenti računalnog inženjerstva pohađaju nekoliko kolegija iz elektronike, umjetne inteligencije, digitalnih logičkih sklopova i digitalnog hardvera, a skloni su proučavanju više fizičkih koncepata. Studenti informatike i informatike obično završavaju studij dovršavanjem velikog projekta koji pokazuje njihove naučene vještine.
Računalni inženjering uključuje mnogo više fizički pristup nego što to čini informatička znanost. Računalni inženjeri grade računalne mreže, sastavljaju hardver i ugrađuju računalne sustave u mnoge vrste objekata. Mogli bi sastaviti ploče ili čak raditi u laboratoriju kako bi pronašli način da računala učine učinkovitijima ili prenosivijima. Računalni inženjeri također mogu surađivati s računalnim znanstvenicima kada znanstvenici stvaraju programe koji će se koristiti sa sustavima koje stvaraju računalni inženjeri. Mala razlika između programiranja koji se koristi u računalnom inženjerstvu i računalnim znanostima je u tome što inženjeri mogu kreirati program koji omogućuje da sustav radi ispravno i dopustiti računalnim znanstvenicima da kreiraju različite programe za glavni operativni sustav.
Računalni znanstvenik se više usredotočuje na apstraktne detalje softverskog inženjeringa, ali također ima velik dio znanja o hardveru koje imaju računalni inženjeri. Oni znaju kako hardver i softver rade zajedno i znaju kako dizajnirati programe koji iskorištavaju prednosti hardverskih značajki. Prilikom izrade svojih programa, računalni znanstvenici koriste svoje znanje o numeričkoj analizi i algoritmima kako bi osigurali da program ispravno izračunava svoje vrijednosti. Izrađuju softverske zakrpe, kompletne programe, pa čak i cijele operativne sustave, a obično rade u timu unutar tvrtke koja uključuje softverske inženjere i druge računalne znanstvenike.