Imiquimod krema se koristi za liječenje genitalnih bradavica, solarnih kerastoza i raka kože bazalnih stanica. Krema djeluje tako što potiče proizvodnju citokina, koji pomažu u eliminaciji virusa i kancerogenih stanica. Krema se također koristi za sprječavanje daljnjeg razvoja mogućih kancerogenih lezija kože. Imiquimod krema se primjenjuje lokalno, a trajanje liječenja može biti od jednog do četiri mjeseca, ovisno o medicinskom problemu koji se rješava. Korištenje može dovesti do nekoliko negativnih nuspojava, uključujući labavo pražnjenje crijeva, simptome slične gripi i bolove u tijelu.
Genitalne bradavice se obično liječe imikvimod kremom umjesto uobičajenim metodama — kauterizacijom i zamrzavanjem — jer je zahvaćeno područje teže dostupno i osjetljivije je za pacijenta. Imiquimod krema daje pojedincima sredstvo za samoliječenje, što može biti značajno za osobe osjetljive na svoje tijelo. Krema se nanosi u blizini genitalija, anusa i drugih zahvaćenih područja najmanje tri puta tjedno; krema se ne smije nanositi izravno u otvore, međutim, jer bi koža iznutra mogla biti previše osjetljiva za tretman. Kako bi dopunili lijek, liječnici savjetuju da pacijenti zahvaćena područja drže čistima i suhima što je više moguće. Nakon 16 tjedana uzimanja lijekova i njege, bradavice treba potpuno ukloniti.
Liječenje solarnih keratoza, također poznatih kao aktinične kerastoze, provodi se nanošenjem kreme na lezije otprilike dva puta tjedno tijekom 16 tjedana. Solarne keratoze nastaju kada keratinociti u najudaljenijem sloju kože rastu do abnormalnog stupnja, što je obično potaknuto prekomjernim izlaganjem sunčevoj svjetlosti. Imunološka stimulacija koju pruža imikvimod krema pomaže u zaustavljanju rasta keratocita, na kraju čisti kožu od poremećaja.
Imiquimod krema se također koristi za liječenje raka kože bazalnih stanica, kao i lezija koje bi se potencijalno mogle razviti u rak. Liječenje se provodi nanošenjem kreme na zahvaćeno područje kože najmanje pet puta tjedno, tijekom najmanje šest tjedana. Tijekom razdoblja liječenja pacijenti mogu primijetiti upalu na svojoj koži – stupanj do kojeg varira ovisno o pacijentovoj reakciji na lijek. Nakon šest tjedana, pacijenti bi trebali imati biopsiju lezija kako bi se utvrdila učinkovitost liječenja. Ako rezultati testa pokažu napredak prema eliminaciji stanica raka, liječenje se provodi onoliko dugo koliko je potrebno, sve dok liječenje ne uspije ili se stanice raka potpuno ne eliminiraju s pacijentove kože.