Glavna veza između jutarnje mučnine i pobačaja je da žene koje imaju mučninu i povraćanje tijekom trudnoće imaju manji rizik od gubitka trudnoće. Osim toga, žene koje uopće ne osjećaju nikakvu bolest imaju blago povećan rizik od pobačaja u usporedbi sa ženama s teškom do umjerenom mučninom. Razlog zašto je to tako nije u potpunosti shvaćen, jer nitko ne zna točno što uzrokuje jutarnje mučnine.
Postoji nekoliko teorija zašto jutarnje mučnine i pobačaj rijetko idu zajedno. Prvi je da je bolest u trudnoći znak da se hormoni brzo povećavaju i izazivaju reakcije u tijelu žene. Nedostatak normalnih simptoma trudnoće, poput mučnine, može biti znak da se razina hormona ne povećava kako bi trebala. Ovi hormoni, prvenstveno progesteron i estrogen, neophodni su za sprječavanje menstruacije i održavanje zdrave trudnoće. Nedostatak ovih hormona može uzrokovati da tijelo ne shvati da je trudno i spontano prekine trudnoću.
Druga teorija o jutarnjim mučninama i stopi pobačaja kaže da su mučnina i povraćanje tijekom trudnoće prirodni način da se osigura da majka ne jede ništa štetno. Povraćanje također može pomoći očistiti želudac od potencijalno štetnih patogena. Ova teorija nije jako podržana, djelomično zato što se žena mnogo puta razboli pri pomisli da jede zdravu hranu, a pritom dobro podnosi junk food.
Postoji li ikakva korelacija između težine jutarnje mučnine i pobačaja nije sasvim poznato. Obično ne postoji određena količina bolesti koja se smatra “zdravom” ili “nezdravom”, sve dok majka još uvijek može jesti i hraniti svoje tijelo i ne dehidrira. Osim toga, žene doživljavaju mučninu u trudnoći na različitim razinama i dužinama bez vidljive veze sa zdravljem trudnoće.
Međutim, ima mnogo žena koje uopće ne osjećaju jutarnje mučnine ili mučninu i rađaju zdrave bebe. Moguće je da kada bi teorija o hormonima bila istinita, te bi žene jednostavno bolje reagirale na povećanje hormona od većine. Druga mogućnost je da se te žene zdravije hrane i izbjegavaju rizične namirnice i druge tvari, te da mogu imati manju potrebu za dodatnom zaštitom od povraćanja i mučnine. Također se može dogoditi da beba ili posteljica proizvode hormone ili enzime zbog kojih neke žene imaju bolest, a druge ne.