Probiotici i enzimi djeluju u tandemu u gastrointestinalnom traktu. I jedno i drugo razgrađuje hranu i tako pomaže boljoj probavi. Enzimi, međutim, idu korak dalje. Oni njeguju probiotike i omogućuju im da ostanu živi i množe se. To je zato što probiotici jedu nusproizvode nastale kada enzimi kemijski probavljaju hranu, razgrađujući je na jednostavne hranjive tvari koje probiotici mogu lako apsorbirati.
Namirnice stvorene enzimima u svrhu potpore probioticima uključuju masne kiseline, jednostavne ugljikohidrate i aminokiseline. Razmjena hrane između probiotika i enzima također uključuje razne minerale i vitamine proizvedene enzimima. Postoji devet različitih vrsta enzima koji proizvode ove hranjive nusproizvode. Djeluju u specijaliziranim područjima gastrointestinalnog trakta, kao što su debelo crijevo, tanko crijevo i gušterača.
Proteaza, amilaza i lipaza smatraju se trima glavnim probavnim enzima. Lipaza probavlja masti poznate kao lipidi i proizvodi masne kiseline kao nusprodukt te probave. Zadatak amilaze je ciljanje škroba i ugljikohidrata, razgrađujući ih u jednostavne šećere koji su dovoljno osnovni da ih probiotici mogu lako konzumirati. Proteaza, posebno enzim proteaza poznat kao pepsin, probavlja proteine kako bi proizveo aminokiseline.
Sekundarni probavni enzimi uključuju saharazu, maltazu i laktazu. Laktaza probavlja mliječni šećer, koji je također poznat kao laktoza. Maltaza kemijski reducira sladni šećer poznat kao maltoza u glukozu. Saharaza probavlja saharozu, stvarajući fruktozu ili glukozu. Preostali enzimi karbohidrata, pektinaza i hemicelulaza ne smatraju se ključnim za probiotike, iako pomažu ljudskom tijelu u probavi.
Aminokiseline i škrob stvoreni u kemijskoj probavi nisu korisni samo za probiotike i enzime. Ljudi također mogu apsorbirati ovu prehranu kroz sluznice organa. Enzimi proteaze prvenstveno služe probiotičkim laktobacilima u tankom crijevu gdje aminokiseline mogu proći kroz membranu u krvotok. Amilaza je u međuvremenu uparena s probioticima u gušterači i žlijezdama slinovnicama gdje se jednostavni šećeri koje oslobađa amilaza mogu apsorbirati kroz usta ili membranu gušterače.
Dok i probiotici i enzimi pretvaraju hranu u energiju kroz probavu, to nije primarna prednost probiotika. Probiotici štite imunološki sustav i povećavaju njegovu učinkovitost uklanjanjem toksina i zlonamjernih bakterija. Kao detoksikator, probiotici su hvaljeni za sprječavanje bolesti u rasponu od alergija do raka debelog crijeva. Ovi korisni mikroorganizmi mogu pomoći tijelu da pobijedi štetne bakterije poput salmonele i E.coli. Što više hrane dobivaju iz enzima, to se više probiotika može umnožiti i pružiti zdravstvenu zaštitu.
Kako ljudi stare ili podnose bolest, količina probiotika u tijelu može naglo pasti. Suplementi s probioticima i enzimima mogu potaknuti tjelesnu korisnu mikrofloru. Oni koji koriste suplemente ili živu hranu za povećanje razine probiotika i enzima u tijelu obično moraju ostati dosljedni jer se i probiotici i enzimi redovito iscrpljuju u tijelu i moraju se nadoknaditi.
Neki kritičari dopunskih probiotika i enzima tvrde da će enzimi, osobito proteaza, uništiti neke probiotike na bazi proteina. Međutim, mnoga istraživanja osporavaju ovu tvrdnju. Kako ne bi došlo do štetnih interakcija, mnogi nutricionisti predlažu da se enzimi uzimaju prije obroka, a probiotici nakon toga.