Štitnjača je žlijezda smještena u vratu koja stvara hormone odgovorne za normalno funkcioniranje metabolizma. Veza između štitnjače i menstruacije varira, ovisno o tome radi li ženina štitnjača normalno, radi li previše ili ne radi dovoljno. Ako štitnjača funkcionira kako bi trebala, najvjerojatnije uopće neće utjecati na menstrualni ciklus žene. Prekomjerno aktivna štitnjača, također poznata kao “hiperaktivna”, ili neaktivna štitnjača, poznata kao “hipoaktivna”, može dovesti do abnormalnih menstrualnih ciklusa, kao i drugih problema.
Kada je štitnjača osobe preaktivna, to je poznato kao hipertireoza. Kao rezultat ovog stanja, štitnjača žene može proizvoditi više hormona nego što je njenom tijelu potrebno. Djevojčice koje imaju prekomjerno aktivnu štitnjaču i probleme s menstruacijom možda neće dobiti menstruaciju tek nakon što navrše 15 godina. Žene koje imaju ovaj problem obično će imati vrlo neredovite i vrlo slabe menstruacije.
Kada se govori o štitnjači i menstruaciji, prekomjerna količina hormona štitnjače često znači da žena može razviti amenoreju ili oligomenoreju. Problem amenoreje odnosi se na potpuni izostanak menstrualnog ciklusa kod žena. Postoje dvije različite vrste amenoreje; prva se zove primarna amenoreja, u kojoj žena nikada nije dobila mjesečnicu, a druga je sekundarna amenoreja, gdje počinje ženski menstrualni ciklus, ali potom prestaje da se javlja. Oligomenoreja je, s druge strane, stanje rijetkih menstruacija, dijagnosticira se kada žena ima samo šest do osam mjesečnica tijekom cijele godine.
Drugi problem koji se javlja zbog povezanosti štitnjače i menstruacije je hipotireoza. U tom stanju štitnjača ne proizvodi dovoljno hormona koji su tijelu potrebni, pa se metabolizam znatno usporava. Mnoge mlade djevojke koje imaju ovaj problem počnu menstruaciju prije desete godine. Ovo stanje može dovesti do simptoma kao što su debljanje, umor, depresija i promjene raspoloženja i često će dovesti do obilnih mjesečnica koje se javljaju mnogo češće nego što bi inače trebale.
Žene koje pate od neaktivne štitnjače i problema s menstruacijom ponekad razviju problem poznat kao menoragija. Uz ovaj problem, menstruacije kod žene mogu postati puno obilnije i trajati dulje. Drugi problem koji se može pojaviti je dismenoreja, koja uzrokuje izrazito bolne mjesečnice. Ovaj problem može uzrokovati jako jake grčeve i bolove u ženinim rukama, nogama, leđima i glavi. Problemi se također mogu pojaviti s crijevima osobe zbog dismenoreje, što uzrokuje neredovito pražnjenje crijeva.