Iako postoji mnogo potencijalnih nedostataka i mnogi ljudi se osjećaju nesigurnim je li ova praksa moralno ispravna ili ne, prednosti kloniranja su brojne. Određene vrste kloniranja mogu se koristiti za stvaranje izvora hrane s višom nutritivnom vrijednošću, dok se druge mogu koristiti za stvaranje vrsta lijekova ili tretmana. Jedna od najpoznatijih prednosti kloniranja je transplantacija organa, koja bi potencijalno mogla spasiti živote žrtava nesreća i onih koji čekaju na donaciju organa.
Medicinske prednosti kloniranja mogu započeti stvarnom ishranom tijela. Ne samo da klonirane krave i kokoši mogu proizvesti više jaja i mlijeka, već bi znanstvenici mogli genetski promijeniti nutritivnu vrijednost ove hrane. Dojenčad nesposobna za dojenje također može imati koristi od određenih vrsta kloniranja životinja. Na primjer, krava čiji se genetski kod manipulira može proizvoditi mlijeko koje sadrži proteine slične onima koji se nalaze u ljudskom majčinom mlijeku.
Plodnost je još jedna od mogućih prednosti kloniranja. Za one koji su sterilni, ovo rješenje može pružiti nadu tamo gdje druge opcije nisu uspjele. Jedan od najčešćih procesa reproduktivnog kloniranja počinje ubrizgavanjem genetskog materijala jednog roditelja u jaje. Kada se to učini, jaje se stimulira strujom ili kemikalijama, a zatim se stavlja u maternicu. Iako je ovaj proces u određenoj mjeri postignut na životinjama, potrebna su daljnja istraživanja kako bi se vidjelo hoće li djelovati i na ljude.
Osim prehrane i plodnosti, dobrobit kloniranja seže u liječenje i moguće liječenje mnogih medicinskih problema. Transplantacija organa najpoznatija je medicinska primjena kloniranja. Ponekad se od životinja uzimaju transplantirani organi, koje ljudi primatelji redovito odbijaju. Međutim, klonirane životinje mogu nositi ljudske gene, što može učiniti odbacivanje rjeđim. Kloniranje također može biti korisno u zamjeni kostiju, hrskavice i kože kod žrtava opeklina i nesreća.
Ostale medicinske prednosti kloniranja sastoje se od stvaranja napredne medicine. Ovi se lijekovi mogu koristiti za liječenje srca i koštane srži, za kontrolu dijabetesa i reumatoidnog artritisa, a možda čak i za liječenje bolesti bubrega i Parkinsonove bolesti. Osim toga, kloniranje bi također moglo izliječiti određene vrste raka zamjenom mutiranih gena zdravim, normalnim. Taj se proces često sastoji od uzimanja imunoloških stanica iz pacijentova vlastitog tijela, umnožavanja i njihovog vraćanja u sustav.