Stabla šljive podložna su velikom broju štetnika i bolesti i zahtijevaju redovito održavanje. Gnojiti voćke i prskati ih fungicidima i pesticidima potrebno je za poticanje snažnog i snažnog rasta. Neke od najčešćih bolesti stabala šljive uzrokovane gljivičnim infekcijama su crni čvor, smeđa trulež, pepelnica, verticilije, višegodišnji rak i šljivini džepovi. Bakterijske bolesti koje zahvaćaju šljivu su krošnjak, bakterijska pjegavost i sačmarica. Bolesti stabala šljive poput virusa boginja šljive i hrđe šljive uzrokuju štetnici poput lisnih uši.
Crni čvor, koji uzrokuje gljiva Dibotryon morbosum, uzrokuje pojavu dugih, tvrdih, crnih čvorova na granama stabla šljive, a ponekad i na glavnom deblu. Višegodišnji rak je slična gljivična infekcija uzrokovana gljivama Valsa cincta i V. leucostoma, a uzrokuje pojavu ovalnih rakova na granama i deblu. U oba slučaja, čvorovi i rakovi na kraju opasuju stablo i ubiju ga.
Gljiva smeđe truleži raste u obliku smeđih čuperaka na cvjetovima šljive, plodovima i malim granama te uzrokuje venuće cvjetova i truljenje plodova. Mnogo uništavanja voća također uništava gljiva taphrina, koja stvara šuplje, proširene prostore poznate kao džepovi šljive u plodovima šljive. Gljiva Podosphaera oxyacanthae uzrokuje pepelnicu, bijelu pepelnicu na donjoj strani lišća šljive koja uništava lišće i usporava rast stabla. Verticillium uvenuće, koje uzrokuje gljivica Verticillium alboatrum, također usporava rast biljaka uzrokujući uvenuće lišća, promjenu boje drveta i truljenje korijena.
Infekcija krunske žuči, koju uzrokuje bakterija Agrobacterium tumefaciens, proizvodi plutaste tumore u biljnom tkivu. Ostale dvije bakterijske bolesti stabla šljive, bakterijska pjegavost i pjegavost, uzrokovane su bakterijama Xanthomonas pruni i Pseudomonas syringae. Na listovima šljive pojavljuju se mrlje i rupice, a listovi tada požute i opadaju. Bakterijska infekcija također stvara rupe na plodovima koji se razvijaju, što uzrokuje njihovo truljenje. Lisne uši šire virus boginja šljive i rđu šljive. U prvom slučaju na proizvodnju ploda utječe deformiranje ili truljenje šljiva u razvoju, au drugom slučaju listovi šljive posrebre se, uvijaju se i venu.
Gljivične infekcije se prenose vjetrom ili zemljom, dok se bakterijske i virusne infekcije mogu prenositi zemljom ili prenositi štetnicima. Za ublažavanje bolesti stabla šljive pomoći će izbjegavanje sadnje stabla šljive na prethodno zahvaćenom području. Kod njege već zaraženog stabla šljive bit će potrebno oboljele dijelove orezati i spaliti, te stablo prskati fungicidima, baktericidima i pesticidima. Važno je napomenuti da fungicidi djeluju uglavnom kao preventiva, a možda neće imati puno učinka na jako zaražena stabla.