Najčešće nuspojave orlistata uključuju crijevni sustav. Orlistat uzrokuje da osoba doživi pojačano pražnjenje crijeva i nekontrolirano pražnjenje crijeva. Druge uobičajene nuspojave orlistata uključuju masnu ili masnu stolicu, rijetku stolicu i masne mrlje na donjem rublju. Osim toga, osoba također može patiti od bolova u trbuhu i rektuma. Ove uobičajene nuspojave su zapravo normalne reakcije na orlistat i znakovi su da lijek ispravno djeluje.
Mogu se pojaviti ozbiljne nuspojave orlistata, a ako se pojave, zahtijevaju hitnu pozornost liječnika; primjeri ozbiljnih nuspojava uključuju tešku alergijsku reakciju, proljev i gubitak apetita, uz mučninu, ekstremni umor i povraćanje. Simptomi alergijske reakcije uključuju otežano disanje, koprivnjaču i oticanje područja lica i grla. Zatajenje jetre i pankreatitis dva su stanja koja se mogu pojaviti kao posljedica orlistata. Znakovi ovih zdravstvenih stanja mogu se preklapati s nekim nuspojavama orlistata, poput gubitka apetita zbog zatajenja jetre i mučnine ili povraćanja zbog pankreatitisa. Drugi znakovi zatajenja jetre su tamni urin, svijetle stolice i žutica, dok su dodatni znakovi pankreatitisa ubrzan rad srca i bol u gornjem dijelu trbuha.
Orlistat je sam po sebi inhibitor lipaze koji djeluje tako da sprječava apsorpciju masti u tijelu. Budući da tijelo ne apsorbira toliko masti koliko bi inače, masnoća napušta tijelo kroz otpad, opuštajući stolicu i čineći je masnom. Kao takav, čini pražnjenje crijeva manje predvidljivim. Za neke osobe, nuspojave orlistata će nestati nakon nekoliko tjedana liječenja, dok će se kod drugih nuspojave pojaviti sve dok uzimaju lijek. Općenito, što više masne hrane sadrži, javlja se više nuspojava, stoga osoba koja uzima orlistat ne bi smjela uživati u previše masnoj hrani.
Svrha orlistata je pomoći kod mršavljenja. Dostupan u obliku na recept i bez recepta, orlistat se koristi u kombinaciji s niskokaloričnom prehranom s niskim udjelom masti, kao i s tjelovježbom. Obrazac bez recepta sadrži dozu niže jačine od obrasca na recept, tako da uzrokuje manje nuspojava. Orlistat koji se izdaje bez recepta nije za osobe mlađe od 18 godina, dok orlistat na recept nije za one u dobi od 12 do 18 godina. Liječnik može propisati orlistat osobama s prekomjernom tjelesnom težinom s određenim stanjima kao što su dijabetes, visoki krvni tlak i visoki kolesterol.