DNA elektroforeza je proces izolacije fragmenta DNA koji se temelji na privlačenju tog fragmenta na električni pol. Ovaj proces se koristi za odvajanje fragmenata DNK na temelju njihovih veličina putem polarnog privlačenja preko električnog gradijenta. Nukleinske kiseline tvore prečke dvostruke spirale DNK, čiju okosnicu čine deoksiriboza šećeri i fosfati, što joj daje negativan naboj. Znanstvenici mogu iskoristiti činjenicu da ovaj negativni naboj privlači pozitivnu elektrodu kroz električno polje.
Proces DNA elektroforeze izvodi se provođenjem DNK preko gel supstrata kroz elektrolitički pufer ili supstrat kao što je slana voda. Gel agaroze koji je natopljen u slanoj vodi može izdržati električni gradijent koji se neprekidno prolazi kroz njega. Izradom mnogih kopija DNK, obično kroz proces koji se naziva polimerazna lančana reakcija (PCR), dati gen se može eksponencijalno kopirati iz jedne pojave. Geni se fizički manifestiraju u segmentima DNK.
Agaroza je porozan supstrat koji omogućuje malim molekulama da prolaze kroz njega. DNA privlači pozitivan naboj, tako da segmenti DNK različitih veličina migriraju kroz elektrolitički agarozni gel unutar električnog polja slane vode. Veliki segmenti migriraju kroz gel supstrat sporije od malih dijelova, tako da su fragmenti DNK razdvojeni po veličini. Provođenjem velikog broja fragmenata DNA iste veličine na agaroznom gelu, uzorak tvori debelu traku.
DNA elektroforeza zahtijeva korištenje elektrolitičkog supstrata, električnog polja i etidijevog bromida, koji je vrlo opasna kemikalija. Etidijev bromid interkalira između nukleinskih kiselina na dvostrukoj spirali DNK i svijetli pod ultraljubičastim (UV) svjetlom. Za vizualizaciju DNK trake na agaroznom gelu, gel se može natopiti etidijevim bromidom i fotografirati pod UV svjetlom. Prikazat će se vrpce koje čine različite veličine fragmenata DNA, a eksperimentator može reći je li gen od interesa – ili fragment DNA – prisutan.
Od najmanjih organizama, poput bakterija, do najvećih organizama, kao što su kitovi, vrste se repliciraju kopiranjem DNK. Šifra za stvaranje proteina potrebnih za život napisana je u genetskim uputama koje pružaju lanci DNK. Analiza DNK koristi se u mnogim znanstvenim studijama, uključujući kriminalističke istrage, genetske studije na životinjskim modelima, bakterijsku rekombinaciju i klasifikaciju peptida. DNK označava kod za transkripciju proteina, tako da je elektroforeza DNK korisna u svakoj situaciji u kojoj bi znanstvenik ili eksperimentator imao razloga za repliciranje, odvajanje ili ispitivanje gena na lancima DNK.