Postoji nekoliko prednosti i nedostataka koje morate razmotriti prije nego što se odlučite za alternativno srednjoškolsko obrazovanje. Fleksibilni nastavni plan i program, manja veličina razreda, niža stopa izostajanja iz nastave i nisko stresno okruženje mogu pružiti okruženje koje potiče bolje učenje. Međutim, teškoća prilagodbe, smanjen broj društvenih interakcija i negativne konotacije povezane s alternativnim obrazovanjem mogu utjecati na to kako se učenik ponaša izvan učionice.
Alternativno srednjoškolsko obrazovanje karakterizira modificirani nastavni plan i program koji ne prati onaj koji se koristi u redovnoj javnoj srednjoj školi. Nastavni plan i program se inače može prilagoditi tempu učenja učenika, što je posebno povoljno za darovite učenike i one koji imaju poteškoća u učenju. Primjer za to može biti čarter škola za darovite, stvorena da razvija akademske i umjetničke talente učenika.
Veličina razreda u alternativnoj srednjoj školi obično je manja od prosječne škole. To omogućuje niži omjer nastavnika i učenika. Niži omjer olakšava veću interakciju između nastavnika i učenika i daje učitelju priliku da često odgovara na učenikova pitanja. Učenici koji imaju poteškoća u interakciji s velikim brojem vršnjaka mogu napredovati u alternativnoj školi. Osim toga, učitelj se može više usredotočiti na ispravljanje nekih nedoličnih ponašanja učenika koja se obično zanemaruju u većem razredu.
Učenici mogu uživati u studiranju u alternativnoj srednjoj školi zbog relativno opuštenog okruženja. Odsutnost velikog broja učenika i strogi nastavni plan i program mogu dovesti do niže razine stresa koja je pogodnija za učenje. Alternativno srednjoškolsko obrazovanje također sprječava učenike da “padnu kroz pukotine” stavljajući veći naglasak na razvoj snaga učenika umjesto održavanja određenog prosjeka ocjena. Studenti uživaju u učenju, a stopa izostajanja je smanjena.
S druge strane, prijelaz s tradicionalnog okruženja na alternativnu školu može biti uznemirujući za učenika, osobito ako se prijelaz napravi kasnije u srednjoj školi, a ne na početku. Grupa na koju je učenik bio naviknut će biti odsutna, što može rezultirati poteškoćama prilagodbe. To se također primjenjuje kada učenik prelazi iz alternativne srednje škole u redovnu srednju školu. Osim toga, nedostatak razredne raznolikosti u alternativnoj srednjoj školi također može utjecati na to kako se učenik druži u budućnosti.
Drugi nedostatak je stigma koja se može vezati za učenike iz alternativne srednje škole. Alternativno srednjoškolsko obrazovanje obično se nudi kao posljednje sredstvo za „rizične” učenike kojima je teško funkcionirati u prosječnom razrednom okruženju. Nadalje, učeniku koji završi alternativnu srednju školu možda će biti teže prijaviti se za posao.