Obično nema sulfita, sintetskih pesticida ili gnojiva koji se koriste u proizvodnji organskog crnog vina, a mnogi ljudi to mogu smatrati dobrom jer neki dokazi sugeriraju da su te stvari potencijalno štetne za konzumiranje. Sulfiti su vrsta konzervansa koji se često koristi u vinu koji ljudima izaziva glavobolje, a sintetički pesticidi i gnojiva su umjetne tvari koje se koriste za odbijanje štetočina i stvaranje zemlje plodnije za uzgoj. Umjetni pesticidi i gnojiva mogu sadržavati otrovne kemikalije koje, kada se konzumiraju, mogu biti štetne za zdravlje osobe. Unatoč mogućim prednostima organskog crnog vina, ono je obično puno skuplje od običnog crnog vina, pa ga iz tog razloga mnogi ljudi možda neće moći redovito kupovati.
Sve vrste crnog vina obično su bogate antioksidansima, koji mogu biti korisni u borbi protiv raka i drugih vrsta bolesti. Organsko crno vino vjerojatno ima veći broj ovih antioksidansa od konvencionalnog crnog vina jer vjerojatno nije bilo toliko obrađeno. Tvari koje se koriste u uzgoju grožđa za crno vino, kao što su sintetička gnojiva i pesticidi, također mogu smanjiti broj antioksidansa koji se prirodno pojavljuju u vinu. Neka neorganska crvena vina mogu dodatno sadržavati umjetne boje i eventualno olovo, koje ponekad prodire u vino tijekom proizvodnje, što može biti potencijalno štetno. Organsko crno vino obično ne sadrži ništa umjetno, uključujući boje, i obično se proizvodi tradicionalnim metodama koje ne uključuju korištenje olova ili drugih kemikalija.
Iako postoje mnoge prednosti ispijanja organskog crnog vina, mnogi smatraju njegovu visoku cijenu glavnim nedostatkom. Nisu sva organska crna vina skupa, ali je većina puno skuplja od običnog crnog vina. Organska vina su obično skupa za proizvodnju zbog održivih poljoprivrednih metoda u kombinaciji sa skupljom, tradicionalnom preradom. Proizvođači organskog crnog vina često moraju naplatiti znatan iznos za svoj proizvod kako bi nadoknadili trošak njegovog stvaranja. Vjerojatno ima mnogo ljudi koji bi radije pili organsko crno vino jer je možda malo zdravije od alternative, ali to ne mogu učiniti jer si to ne mogu priuštiti.
Možda postoje neki nedostaci pijenja crnog vina koje nije organsko, ali većina stručnjaka se slaže da su sintetički materijali koji se koriste u procesu proizvodnje obično prisutni u tako malim količinama da vjerojatno ne bi imali veliki utjecaj na zdravlje osobe. Crveno vino koje je organsko moglo bi biti dobra povremena alternativa neekološkoj sorti, ali osoba koja si to ne može priuštiti vjerojatno ne bi trebala biti previše zabrinuta zbog pijenja neorganskog vina. Sve vrste vina, bilo organska ili neorganska, najbolje je konzumirati oprezno i umjereno zbog visokog udjela alkohola.