Testiranje amniocenteze može obiteljima i njihovim zdravstvenim djelatnicima ponuditi važne informacije o dobrobiti bebe u razvoju. Može pomoći liječniku da dijagnosticira genetske poremećaje i procijeni je li fetus dovoljno zreo da preživi izvan maternice. Međutim, ovaj postupak nije bez rizika. Komplikacije amniocenteze mogu uključivati infekciju, krvarenje, istjecanje amnionske tekućine, pobačaj i ozljede fetusa. U nekim slučajevima postupak ne daje točne informacije o fetusu.
Najveća prednost testiranja amniocenteze je to što daje uzorak genetskog materijala fetusa u razvoju. Ove informacije su ključne za postavljanje preciznije prenatalne dijagnoze genetskih sindroma. Iako ultrazvuk i pretrage krvi majke mogu sugerirati stanja kao što je Downov sindrom, amniocenteza daje točniju dijagnozu.
Testiranje amniocenteze također je važno u procjeni žena s rizikom za prijevremeni porod. Uzorak dobiven zahvatom može se testirati kako bi se procijenilo koliko su zrela pluća fetusa. Nezrela pluća mogu sugerirati da bi žena trebala pokušati zadržati trudnoću što je duže moguće kako bi svojoj bebi pružila najbolju šansu za preživljavanje nakon rođenja. Nasuprot tome, test koji sugerira da su zrela pluća mogla promijeniti ravnotežu u korist rađanja prijevremeno rođene bebe.
Nažalost, postoji niz rizika testiranja amniocenteze. Neki od rizika povezani su s činjenicom da je amniocenteza invazivan zahvat. Uvijek postoji mogućnost infekcije, bilo majčine kože ili amnionske tekućine koja okružuje fetus u razvoju. Žene bi mogle pretjerano krvariti kao rezultat postupka. Neke žene doživljavaju trajno istjecanje amnionske tekućine s mjesta ulaska igle.
Pobačaj nakon amniocenteze je još jedan nedostatak postupka. Različiti istraživači su procijenili različite stope gubitka fetusa nakon amniocenteze. Općenito, rizik od pobačaja nakon zahvata procjenjuje se na 1.1 do 2.2%. Ovo je povećanje sa stope od 0.7 na 1.5% kod usporedivih žena koje nisu bile podvrgnute amniocentezi. Drugim riječima, rizik od pobačaja povezan s zahvatom kreće se od jedan na 300 do jedan na 500.
Ostali rizici testiranja amniocenteze mogu se smatrati lošim stranama postupka. Igla može ozlijediti fetus u razvoju, iako je taj rizik rijedak jer je postala uobičajena praksa koristiti ultrazvuk za vođenje igle. Ponekad stanice dobivene u tekućini amniocenteze nisu reprezentativne za genetski sastav fetusa u razvoju, a genetske dijagnoze dobivene analizom tih stanica mogu biti netočne. Postupak također nije uvijek uspješan, što znači da se povremeno prikupi nedovoljna količina tekućine za potpunu analizu.