Brojne su zabilježene zdravstvene prednosti kombuche, kao što su poboljšanje imunološkog sustava, poboljšana funkcija jetre, bolja probava i prevencija raka. Kako je kombucha čaj postao popularan, mnogi su se ljudi usredotočili na ove tvrdnje. Važno je, kao i kod svih modnih namirnica i pića, pregledati istraživanja koja bi mogla podržati takve tvrdnje. Iako je bilo brojnih osobnih izvješća o dobrobitima kombuche i nekih laboratorijskih studija, te prednosti nisu široko prihvaćene u zapadnoj medicinskoj zajednici. Nadalje, postoje izvješća o pojedincima koji su doživjeli štetne učinke kao rezultat pijenja kombuche.
Iako je većina znanosti koja stoji iza prednosti kombuche pomalo mekana ili neprihvaćena od strane zapadne medicinske zajednice, mnogi se ljudi zaklinju u kombucha čaj kao čudesno piće. Postoje i naznake da ljudi na Istoku već stoljećima uživaju u blagodatima kombuche. Za neke su izvještaji da kombucha liječi i promiče zdravlje tako dugo vremena dovoljan dokaz.
Kako znanost koja stoji iza prednosti kombuche nedostaje, tvrdnje o sposobnostima pića prilično su nejasne. Nije moguće, na primjer, tvrditi da će piće poboljšati mentalnu oštrinu ako nema dovoljno dokaza koji potkrepljuju ovu činjenicu. Široke tvrdnje o dobrobitima kombuche uključuju poboljšanje općeg zdravlja i dobrobiti, kao i one gore navedene. Moguće je, međutim, da će dokazi u budućnosti ili potvrditi ili napraviti rupe u ovim tvrdnjama.
Štetni učinci kombuche obično su povezani s želučanim tegobama. To može biti zato što je piće prilično kiselo. S druge strane, mnogi ljudi navode da je jedna od najboljih prednosti kombuche poboljšana probava. Ostali štetni učinci kombuche mogu imati veze s vrstom bačve ili staklenke koja se koristi za uzgoj pića. Ako je staklenka izrađena od materijala kao što je glina, moguće je da piće postane zaprljano olovom, sastojkom koji se ponekad koristi u glazurama za ove vrste staklenki.