Neke prepreke međunarodnoj trgovini uključuju razlike u jeziku, kulturi, zakonima i propisima. Trgovačke tvrtke također mogu naići na nesporazume oko uvjeta ugovora, što dovodi do problema s plaćanjem robe, vozarine ili osiguranja. Zakoni o zemljištu, zapošljavanju, intelektualnom vlasništvu i javnom zdravstvu razlikuju se od zemlje do zemlje i mogu uzrokovati probleme međunarodnim poduzećima. Kretanje tečaja valuta i rastuća inflacija ili kamatne stope u stranoj zemlji zamka su za neoprezne trgovce. Carine i kvote na uvoznu robu, u kombinaciji sa subvencijama za domaću industriju, opterećuju inozemna poduzeća u mnogim zemljama.
Prijevoz robe nekoć je bio jedna od prepreka međunarodnoj trgovini, ali razvoj modernih teretnih brodova, kontejnerizacija i sofisticirane kontejnerske luke – uključujući unutarnje suhe luke – doveo je do smanjenja ovih logističkih problema. Nesporazumi u međunarodnim ugovorima smanjeni su razvojem standardiziranih uvjeta ugovora, dok vlade često daju podršku poput jamstava tvrtkama koje traže financiranje izvoza. Tvrtke će možda trebati potražiti savjet za zaštitu od kretanja valuta i financijskih rizika trgovanja u drugoj zemlji, uključujući inflaciju i fluktuirajuće kamatne stope.
Prilikom osnivanja podružnice ili podružnice u drugoj zemlji, poduzeća se moraju boriti sa zakonima o licenciranju, zakonima o trgovačkim društvima, propisima o ulaganjima i poreznim pravilima. Općenito im je potreban lokalni poslovni savjet za rješavanje takvih problema, ali mogu postojati i prilike kao što su slobodne zone ili posebne gospodarske zone u drugoj zemlji. Zdravstveni i sigurnosni propisi mogu uzrokovati probleme tvrtkama koje posluju u određenim industrijama, uključujući industriju hrane i proizvoda za djecu. Neke tvrtke će možda morati modificirati svoje proizvode kako bi uzele u obzir lokalne običaje i ukuse.
Najvidljivije prepreke međunarodnoj trgovini su carine i kvote. Industrijalizirane zemlje često postavljaju visoke carine na uvezenu poljoprivrednu robu i to mogu kombinirati sa subvencijama za svoje domaće poljoprivredne proizvođače. Također mogu nametnuti kvote koje ograničavaju količinu određene proizvodne robe koja se uvozi svake godine. Zemlje u razvoju mogu postaviti carinske barijere na uvoz robe u određenim industrijama kako bi zaštitile svoje pionirske proizvođače. Unatoč općem suglasju da protekcionizam šteti međunarodnoj trgovini i nacionalnim prihodima, zemlje općenito vode računa o vlastitim nacionalnim interesima kada razmatraju trgovinska pitanja.
Međunarodne organizacije poput Svjetske trgovinske organizacije (WTO) su domaćini razgovora i pregovora o preprekama međunarodnoj trgovini. One se često usredotočuju na osjetljiva pitanja kao što su tarife i subvencije na poljoprivredne proizvode, carine i kvote nametnute na proizvedenu robu i prepreke pružanju usluga na međunarodnoj razini. Još jedno osjetljivo pitanje u međunarodnoj trgovini je zaštita intelektualnog vlasništva, jer se međunarodne tvrtke često žale da je patentna zaštita nedovoljna u nekim zemljama.