Svi lijekovi i cjepiva uzrokuju nuspojave, iako su u nekim slučajevima vrlo blage i možda neće biti očite. Općenito, nuspojave cjepiva protiv hepatitisa B su blage i ne prijeteće, ali postoje neke umjerene do teške nuspojave koje se mogu pojaviti u rijetkim slučajevima. Cjepivo protiv hepatitisa B je rekombinantno cjepivo napravljeno od sintetskih verzija proteina iz virusa hepatitisa B. To nije živi ili ubijeni virus i stoga ne može uzrokovati infekciju hepatitisom B. Ovo cjepivo je sigurno za gotovo sve ljude, uključujući dojenčad, djecu i starije osobe.
Najčešće nuspojave cjepiva protiv hepatitisa B vrlo su blage i nisu opasne. Otprilike 25 posto ljudi koji su primili cjepivo osjetit će bol na mjestu injekcije. Otprilike jedna od svakih 15 ljudi imat će temperaturu od 99.9 stupnjeva Fahrenheita (37.7 stupnjeva Celzija) ili više.
Postoje mnoge druge moguće nuspojave cjepiva protiv hepatitisa B, od kojih je većina rijetka ili ne prijeteća. Respiratorne nuspojave koje se mogu pojaviti uključuju kašalj, rinitis, infekciju gornjih dišnih puteva, simptome nalik gripi i simptome nalik astmi. Mogu se javiti smetnje vida, bolovi u zglobovima i mišićima ili ukočenost, natečeni limfni čvorovi i blage alergijske reakcije. Abnormalni testovi funkcije jetre neuobičajena su nuspojava; ozbiljniji problemi s jetrom kao što su rak ili bolest jetre nisu prijavljeni kao nuspojave.
Teška alergijska reakcija na cjepivo protiv hepatitisa B iznimno je rijetka, javlja se s učestalošću od otprilike jedan na 1.1 milijun. Simptomi nuspojava alergijskog cjepiva protiv hepatitisa B uključuju koprivnjaču ili osip, stezanje u prsima, otežano disanje i oticanje lica, usana, jezika ili usta. Ako netko tko je primio cjepivo protiv hepatitisa B doživi ove nuspojave, treba odmah potražiti hitnu liječničku pomoć.
Druge potencijalno teške nuspojave cjepiva protiv hepatitisa B uključuju nuspojave na živčani sustav, kardiovaskularne i imunološke nuspojave. Kardiovaskularne nuspojave uključuju nizak krvni tlak, nesvjesticu, lupanje srca i ubrzan rad srca. Na imunološki sustav može utjecati autoimuna bolest sistemski eritematozni lupus ili vaskulitis, u kojem se krvne žile u blizini mjesta infekcije upale.
Postoji nekoliko mogućih nuspojava na živčani sustav koje se mogu pojaviti nakon primjene cjepiva protiv hepatitisa B. Privremeni blagi simptomi uključuju glavobolju, vrtoglavicu, vrtoglavicu, nesanicu i pospanost. Konvulzije i upalne bolesti živčanog sustava kao što su encefalitis i mijelitis su druge moguće posljedice. Osobe s multiplom sklerozom mogu doživjeti pogoršanje simptoma nakon cijepljenja protiv hepatitisa B.