Partnerski programi web stranica omogućuju trgovcima da plaćaju podružnicama za usmjeravanje prometa na određenu web stranicu. Postoje različiti načini kompenzacije affiliate web stranice ili bloga, a najčešća metoda je cijena po prodaji. To nagrađuje podružnicu postotkom svake prodaje koju on ili ona napravi. Affiliate programi cijene po akciji, s druge strane, plaćaju afilijatu određene radnje kao što je prijava za besplatnu probnu verziju ili račun. Najrjeđi tip je cijena po kliku, koja plaća afilijatu po posjetitelju.
Sve vrste affiliate programa na web stranicama oslanjaju se na ista osnovna načela bez obzira na način naknade. Web-mjesto s afilijacijskim programom nudi plaćanje afilijatu za promet poslan na tu web stranicu, bilo putem web-mjesta afilijacije ili na neki drugi način. Prednost je u tome što trgovac na web stranici prima promet bez potrebe da ga izravno generira, a podružnica može zaraditi novac bez prodaje vlastitog proizvoda ili usluge.
Cijena po prodaji (CPS) najčešća je vrsta afilijacijskih programa web stranica. S ovom metodom kompenzacije, affiliate prima proviziju za svaku stavku koju kupe posjetitelji web stranice podružnice. Za fizičke proizvode postotak provizije je često između 5-20% ovisno o affiliate programu. Provizija za digitalne proizvode, kao što su e-knjige, može biti puno veća.
Partnerski programi web-mjesta s cijenom po radnji slični su CPS-u, ali podružnica dobiva plaću kada posjetitelj dovrši radnju umjesto da kupi proizvod. To može biti prijava za račun ili unošenje adrese e-pošte. Isplata za affiliate proviziju cijene po akciji često je fiksni iznos, a ne postotak. Mnoge podružnice preferiraju affiliate programe web-mjesta cijene po akciji od cijene po prodaji jer je često lakše navesti posjetitelja da se prijavi za besplatni račun nego da izvrši kupnju.
Manje uobičajena vrsta affiliate programa je cijena po kliku. Uz ovu vrstu programa, affiliate dobiva plaću za svakog posjetitelja poslanog na web stranicu trgovca, bez obzira na to koliko ih kupi proizvod ili izvrši akciju. Vrijednost svakog klika obično ovisi o vrijednosti posjetitelja na određenom tržištu kao i o kvaliteti prometa. Kvaliteta prometa varira ovisno o izvoru prometa i o tome koliko će posjetitelji vjerojatno biti zainteresirani za proizvode web stranice.