Alati za webmastere korisni za poboljšanje web-mjesta uključuju alate za kreiranje navigacije web-mjesta prilagođene korisniku, dijagnostičke alate za prepoznavanje stvari kao što su stranice s pogreškama ili neispravne veze te alate za analizu prometa. Webmasteri koriste niz različitih instrumenata za dizajn web stranica koje su jednostavne za korištenje, učinkovite i koje pomažu u postizanju većeg indeksiranja. Mnoge webmasterske alate kreiraju drugi webmasteri i nude ih besplatno, dok se drugi specifičniji alati mogu kupiti uz naknadu.
Mnogi popularni alati za webmastere osmišljeni su kako bi poboljšali korisničko iskustvo prilikom posjete web stranici. Jedan od takvih alata je mapa web-mjesta, koja za korisnike djeluje kao neka vrsta tablice sadržaja. Alati za webmastere za izradu karte web-lokacije često nude neovisni programeri i lako ih je instalirati na web-stranicu. Nakon instalacije, korisnici mogu pretraživati kartu web-mjesta za određeni sadržaj ili kao način za pregledavanje cijelog dostupnog sadržaja na web-mjestu.
Alati za webmastere također su korisni za stvari poput identificiranja dijelova web-mjesta koji možda ne rade ispravno. U takvim slučajevima dijagnostički alati govore webmasteru kada postoji problem s vezama koje možda ne rade ispravno ili kada određene stranice vode do poruke o pogrešci kada korisnik pokuša pristupiti. Alati poput ovih smatraju se ključnima za opći uspjeh web-mjesta, jer odmah upozoravaju vlasnika stranice na područje koje treba popraviti, a da vlasnik ne mora ručno provjeravati svaku stranicu ili vezu.
Analitički alati za webmastere također se smatraju ključnim za uspjeh stranice. Pomoću ovih alata webmaster je u mogućnosti analizirati promet koji ulazi na web stranicu, kao i steći razumijevanje o tome što korisnici rade nakon pristupa web stranici. Na primjer, alati za webmastere koji analiziraju promet govore webmasteru koje su ključne riječi korištene u upitima za pretraživanje koji vode do web-mjesta, koje veze s drugih web-mjesta vode posjetitelje na web-lokaciju, za koje su stranice posjetitelji najviše zainteresirani, koliko dugo posjetitelji provode web-mjestu i koliko je posjetitelja novih ili koliko ih je već pristupilo stranici. Takvi su alati važni instrumenti u pomaganju webmasteru da razvije stranicu koja najbolje odgovara njezinim ili njegovim potrebama posjetitelja.
Iako se nudi više alata za više namjena, kada su odgovarajući alati za webmastere odabrani i pravilno korišteni, webmasteri smatraju da su korisni pri indeksiranju. Ugađanjem web-mjesta tako da nudi najbolje korisničko iskustvo unutar određene niše, stranica stječe popularnost, što povećava posjetitelje i ulazne veze s drugih web-mjesta, te pomaže povećati rangiranje web-mjesta na tražilicama i vidljivost stranice. Osim dijagnostičkih i analitičkih alata, drugi alati, kao što su teme, gadgeti i dodaci, također se mogu koristiti za pomoć webmasteru u izradi web-mjesta ili za dodavanje estetske privlačnosti web-mjestu.