Postoji bezbroj vrsta bakterija, od kojih su neke patogeni, a neke su neophodne za život. Patogeni uzrokuju bolesti kod ljudi ili biljnog svijeta. Neke vrste bakterija ovog tipa uključuju H. pylory, koji uzrokuje gastrointestinalne bolesti, i streptococcus, koji uzrokuje strep grlo. Korisne bakterije koje uspijevaju u ljudskom crijevnom traktu i promiču dobro zdravlje poznate su kao vrsta probiotika koji se naziva acidofil ili laktobacil. Aerobne bakterije zahtijevaju kisik za preživljavanje, dok anaerobne bakterije ne mogu tolerirati kisik i općenito uspijevaju pod vodom.
Bakterije su mikrobi ili jednostanični organizmi, a vrste bakterija mogu varirati. Ti se bakterijski mikrobi mogu vidjeti samo uz pomoć mikroskopa velike snage. Ovisno o strukturi bakterija i vrsti, oni će se vidjeti u različitim oblicima. Bacili su naziv za svaku bakteriju koja je u obliku štapa. Spirilla je naziv za sortu u obliku spirale, a cocci je naziv za bakterije u obliku kugle.
Staphylococcus Aureus je vrsta bakterija koja može biti vrlo opasna za ljudsko zdravlje. Uzrokuje trovanje hranom kada se hrana kontaminira ovom bakterijom. Posebno su podložni kontaminaciji mliječni proizvodi i meso. Ova vrsta bakterija također može uzrokovati infekcije stafilokokom. Bakterije ulaze u kožu kroz otvorenu ranu i mogu uzrokovati infekcije kože koje zahtijevaju liječenje.
Patogene vrste bakterija poznate kao Clostridium botulinum mogu uzrokovati ozbiljne bolesti, poput botulizma koji se prenosi hranom. Med je jedna hrana za koju se zna da nosi spore klostridija. U zdravih odraslih osoba ove spore su općenito bezopasne. Međutim, kod osoba s oslabljenim imunološkim sustavom ili djece mlađe od jedne godine, konzumacija meda može biti rizična.
Escherichia coli, poznatija kao e.Coli, bakterijska je vrsta koja uzrokuje iznimno ozbiljne napade trovanja hranom. U nekim slučajevima, ovaj soj može biti smrtonosan ako se pravodobno ne pruži odgovarajući medicinski tretman. Postoje deseci sojeva ove bakterije, od kojih je većina obično netoksična. Nekoliko sojeva može uzrokovati teške infekcije gastrointestinalnog trakta.
Bakterijska vrsta poznata kao legionella pneumophila može uzrokovati ozbiljne infekcije pluća. Jedna od najzapaženijih infekcija koju ovaj soj bakterija može uzrokovati zove se legionarska bolest. Jedan oblik ove bolesti uzrokuje upalu pluća. Ova bakterija uspijeva u vrućoj vodi i toplim okruženjima.
Postoji bezbroj vrsta bakterija, od kojih svaka ima svoju bakterijsku strukturu i svrhu. Identificiranje svake vrste ne bi bilo zamislivo. Uvijek se pojavljuju različite podvrste bakterija.