Postoji niz vrsta akvakulturnih farmi koje uzgajaju razne vrste riba, rakova i mekušaca. Postoje i farme akvakulture koje uzgajaju vodene biljke, poput morskih algi. U mnogim su slučajevima ove biljke i životinje namijenjene prehrani ljudi, ali postoji nekoliko iznimaka. Na primjer, neke farme akvakulture uzgajaju ribu koja je namijenjena za korištenje u akvarijima. Ove vrste riba često se nazivaju ukrasnim ribama.
Neka od najčešćih farmi akvakulture su ribnjaci, uzgajališta kamenica i uzgajališta škampa. Farme ove vrste mogu koristiti brojne metode za podizanje svojih zaliha. U nekim slučajevima, većina operacija odvija se u spremnicima i objektima koji se nalaze na kopnu. Drugi koriste objekte koji se nalaze uz obalu. U tim slučajevima, stoka se uzgaja u prirodnom morskom okruženju koje je ograđeno ili na neki način regulirano ribarstvom.
Farme koje koriste prirodno morsko okruženje za podizanje stoke umjesto da se u potpunosti oslanjaju na operacije na kopnu prakticiraju ono što se naziva marikultura. Praksa spada pod okrilje akvakulture. Proizvodi koji se beru na ovakvim farmama često se proizvode za iste svrhe i prodaju na istim tržištima kao i proizvodi poljoprivrednih gospodarstava na zemlji.
Kada farme uzgajaju vodene biljke, one sudjeluju u procesu koji se naziva algakultura, koja, kao i marikultura, spada pod okrilje akvakulture. Postoje različite namjene za proizvode koji se uzgajaju na farmama algakulture. Alge koje se uzgajaju na ovakvim farmama imaju i komercijalnu i industrijsku upotrebu. Može se koristiti za razne proizvode, od hrane do bioplastike.
Aquaponic farme su farme akvakulture koje integriraju uzgoj biljaka i ribe ili školjaka. Ove vrste farmi koriste ciklički sustav u kojem se biljke i vodene životinje oslanjaju na simbiotski odnos. Otpad koji proizvodi određena vrsta ribe, na primjer, može se filtrirati iz vode pomoću određene vrste biljke. Osim što filtriraju vodu i detoksifikuju je za ribe, biljke se također oslanjaju na otpad za svoje hranjive tvari. Ove vrste farmi akvakulture često su vrlo učinkovite u korištenju vode.