Postoje tri osnovne vrste kirurgije lipoma kada je potrebna kirurška intervencija, a sastoje se od liposukcije, enukleacije i ekscizije. Liposukcija je vrsta estetske kirurgije koja se može koristiti za uklanjanje nekih izraslina, iako ovom vrstom zahvata možda neće biti moguće ukloniti cijelu izraslinu. Enukleacija se u nekim slučajevima može koristiti za uklanjanje vrlo malih lipoma s minimalnim ožiljcima. Ekscizija je najčešće korištena vrsta operacije lipoma i uključuje uklanjanje cijelog tumora. O svim pitanjima ili nedoumicama o najboljoj vrsti operacije lipoma u pojedinoj situaciji potrebno je razgovarati s liječnikom ili drugim medicinskim stručnjakom.
Liposukcija može biti koristan oblik operacije lipoma u nekim slučajevima gdje su ti tumori prisutni. Ova metoda liječenja osobito je važna kada se zahvaćeno područje nalazi na dijelu tijela gdje treba izbjegavati velike ožiljke. Lokalni anestetik, kao što je razrijeđeni lidokain, općenito osigurava odgovarajuću kontrolu boli za ovu vrstu uredskog zahvata.
Enukleacija je vrsta operacije lipoma koja se može koristiti za uklanjanje vrlo malih lipoma. Za ovaj zahvat pravi se vrlo mali rez neposredno iznad tumora. Mali kirurški alat poznat kao kireta stavlja se unutar reza i nježno se pomiče tako da se tumor pažljivo odvaja od okolnog tkiva. Šavovi obično nisu potrebni kod ove vrste minimalno invazivne kirurgije lipoma, a posebna vrsta tlačne gaze obično se stavlja na kiruršku ranu kako bi se spriječilo stvaranje krvnih ugrušaka.
Najčešći tip operacije lipoma je operacija ekscizije. Lokalni anestetik se obično koristi za umrtvljenje zahvaćenog područja, iako se povremeno može koristiti i opća anestezija, ovisno o veličini i mjestu tumora kao i cjelokupnom zdravstvenom stanju pacijenta. Vrsta kirurškog noža poznatog kao skalpel zatim se koristi za rez kroz kožu, kao i bilo koje okolno masno tkivo. Ovo se smatra pomalo delikatnom operacijom, jer je važno za kirurga da izbjegne slučajno zarezivanje u bilo koji od okolnih živaca ili krvnih žila.
Komplikacije nakon operacije lipoma su rijetke, iako se o svim problemima treba prijaviti liječniku radi daljnje medicinske procjene. Infekcije kože su među najčešće prijavljenim komplikacijama i obično se mogu liječiti antibioticima na recept ako se uhvate rano. Rijetko se tijekom zahvata mogu oštetiti mišići ili živci, što ponekad zahtijeva dodatne operacije za popravak oštećenja.