Različite vrste liječenja hidronefroze općenito ovise o mjestu opstrukcije, budući da je početni cilj drenirati zarobljeni urin. Nakon što je urin uklonjen, fokus liječenja prebacuje se na osiguranje da se problem više ne ponovi. Liječenje hidronefroze obično počinje umetanjem katetera ili cijevi u tijelo kako bi se odvodila tekućina. Nakon što se to završi, blokadu je često potrebno ukloniti obično kirurškim zahvatom.
Uklanjanje zarobljene mokraće i ublažavanje pritiska na bubreg primarni je cilj liječenja hidronefroze, jer je to važno u sprječavanju oštećenja bubrega. Često se to postiže kroz kateter koji se ubacuje u mjehur. Međutim, liječenje nakupljanja mokraće ponekad uključuje umetanje mekih cjevčica izravno u bubreg. U većini slučajeva, blokada u gornjem dijelu mokraćnog sustava zahtijeva cijev, dok blokada u donjem dijelu zahtijeva kateter.
Dreniranje urina iz bubrega bitan je dio liječenja hidronefroze, ali ne rješava temeljni problem. Začepljenje je obično potrebno ukloniti, inače će se urin s vremenom ponovno nakupiti. Ne zahtijevaju svi slučajevi operaciju, ali većina to čini.
Kao i kod procesa drenaže, vrsta operacije hidronefroze ovisi o mjestu blokade. Liječenje hidronefroze za uklanjanje blokade je, međutim, bitno; ako se ostavi dulje vrijeme, stanje može uzrokovati trajno oštećenje bubrega. U prošlosti su se koristile otvorene ili laparoskopske kirurške tehnike, ali endoskopska kirurgija je sada češća za ovo stanje i obično je manje invazivna.
Ako je začepljenje uzrokovano sužavanjem mokraćovoda, koji je cijev koja prenosi mokraću do mokraćnog mjehura, tada će možda biti potrebna operacija za uklanjanje ovog dijela. Ako je stanje uzrokovano kamencem u bubregu, često je potrebno i uklanjanje. Mnogi ljudi se potpuno oporave od operacije hidronefroze, sve dok se stanje otkrije relativno rano.
Odgovarajuće liječenje također ovisi o težini stanja te o tome je li kronično ili akutno. Ako je stanje kronično, što znači da se polako razvija, tada liječenje obično nije hitno, ali će se morati dogoditi u nekoj fazi. Ako su simptomi akutniji, drenažu mokraće možda će trebati obaviti brže kako bi se spriječilo dugotrajno oštećenje bubrega.