Svako pojedinačno liječenje proktitisa izravno ovisi o uzroku samog proktitisa, kao što je spolno prenosiva bolest ili zračenje. Liječenje proktitisa može uključivati liječenje infekcije ili prestanak uzimanja lijekova koji bi mogli uzrokovati upalu. Antibiotici, čepići i drugi lijekovi također se mogu propisati za liječenje bolesti.
Kada je uzrok upale sluznice rektuma povezan sa spolno prenosivim bolestima (STD), antibiotici se obično daju pacijentu. To se radi kako bi se izliječila i bolest, ako je moguće, kao i upala. Drugi specifični lijekovi za spolno prenosive bolesti također se mogu davati kao liječenje proktitisa, ovisno o zaraženoj bolesti.
Crohnova bolest, ulcerozni kolitis i druge bolesti koje mogu uzrokovati proktitis općenito se liječe lijekovima na recept. Mogu se uzimati kao klistiri ili čepići. Ponekad se oralni lijek može propisati zajedno s jednom od ovih metoda. Ako je uzrok proktitisa terapija zračenjem koja ne može prestati, liječenje može uključivati lijekove koji pomažu pacijentu da zaustavi krvarenje, kao i lijekove koji pomažu u uništavanju oštećenog tkiva koje uzrokuje upalu.
Ako je infekcija uzrok upale, propisani lijekovi ovisit će o vrsti infekcije. Obično se daju antivirusni ili antibiotici za borbu protiv infekcije i proktitisa. Ako upalu uzrokuje stanje nadraženog crijeva, liječenje proktitisa može rezultirati operacijom, iako liječnici obično pokušavaju iscrpiti sve druge linije liječenja prije nego što pribjegnu operaciji. Protuupalni lijekovi često mogu pomoći pacijentima u upravljanju proktitisom i pomoći im da izbjegnu operaciju.
U slučajevima blage do teške nelagode, liječenje proktitisa obično uključuje topikalne kreme ili druge lijekove za ublažavanje boli. Oni mogu biti na recept ili dostupni u slobodnoj prodaji. Dodaci vlaknima i omekšivači stolice također se mogu davati kako bi olakšali ili spriječili bol, kao i opći lijekovi protiv bolova koji se mogu kupiti bez recepta.
Neke vrste liječenja proktitisa mogu biti i prirodne. Pacijenti s manjom boli ili oni koji se žele suzdržati od uporabe droga mogu se upustiti u sjedeće kupke ili uranjati u toplu vodu u maloj sjedalici koja se nalazi iznad WC školjke kako bi liječili svoje simptome. Prehrana s niskim reziduom, ili posebna skupina namirnica dizajniranih da rezultiraju najmanjom mogućom količinom stolice, još je jedan mogući prirodni tretman. Bolesnicima se također savjetuje da ne jedu prije spavanja kako bi izbjegli simptome proktitisa.