Medicinski ablatori su kemikalije i instrumenti koji izlažu tkiva ekstremno niskim ili vrućim temperaturama. Tkiva odmah odumiru kada su izložena kauterizaciji ili zamrzavanju, a kirurzi tada lako mogu ukloniti tkivo. Zahvati ablacije su obično manje invazivni i zahtijevaju kraće vrijeme oporavka od ostalih kirurških zahvata. Liječnici mogu obaviti medicinsku ablaciju bilo gdje na tijelu od površine kože do tkiva duboko u njoj.
Kardiokirurzi provode zahvate medicinske ablacije koristeći alkohol za liječenje hipertropne kardiomiopatije. Pacijenti s dijagnozom ovog stanja doživljavaju zadebljanje stijenke septuma srca. Liječnici obično izvode zahvat u laboratoriju za katerizaciju s pacijentom budnim, ali blagom sedacijom. Uz vodstvo tehnologije snimanja, kardiolog provlači kateter kroz krvne žile koje vode do srca. Alkohol ubrizgan kroz kateter dolazi u kontakt sa zadebljanom stijenkom, uništavajući i skupljajući uvećano tkivo.
Dermatolozi koriste kemikalije za postupke dermoabrazije i mikrodermoabrazije. Ova vrsta medicinske ablacije uzrokuje ljuštenje kože. Krioablacija plinom argonom također se koristi za zamrzavanje neželjenog biološkog tkiva na temperature ispod nule. Jednom zamrznuto, tkivo se stvrdne i stručnjaci koriste abrazivnu četku ili dijamantni kotačić za uklanjanje tkiva sloj po sloj. Pacijenti se mogu podvrgnuti površinskoj ablaciji zbog ožiljaka od akni, finih bora ili abnormalnih izraslina.
Kirurzi također koriste krioablaciju za uništavanje unutarnjih tumora promjera do 2 inča (5 centimetara). Kroz mali rez, liječnici ubacuju šuplji štapić. Vođen kompjuterskom tomografijom ili ultrazvukom, štapić stiže na mjesto tumora i ispušta ledeni plin u tumor. Stanice umiru pri kontaktu i postaju bezopasno ožiljno tkivo.
Medicinska ablacija ponekad uključuje laserske ili radiofrekventne terapije. Tijekom operacije, liječnici koriste lasere umjesto konvencionalnih skalpela za spaljivanje i rezanje tkiva uz kauterizaciju krvnih žila. Laseri se također često koriste za lokalne kozmetičke postupke. Radiofrekvencijska ablacija, također poznata kao Cobalation®, koristi kombinaciju radio valova i slane otopine, stvarajući zagrijano plazma polje između dvije elektrode. Tkivo podvrgnuto ovom polju plazme odmah isparava.
Kardiologija, ginekologija i otorinolaringologija su neka od područja koja eliminiraju abnormalno tkivo pomoću kontrolirane radiofrekventne ablacije. Kardiolozi ispravljaju abnormalne srčane ritmove blokirajući nepravilne električne putove u srcu. Ginekolozi mogu ukloniti tumore mioma maternice pomoću Coblation®-a. Stručnjaci za uho, nos i grlo obično koriste ovu metodu za uklanjanje krajnika i adenoida ili za ispravljanje nedostataka nepca koji uzrokuju apneju u snu ili hrkanje.