Medicinske sonde dolaze u dvije osnovne vrste: instrumenti ili tvari. Obje se općenito koriste za istraživanje područja tijela koja možda nisu lako dostupna. Prve vrste uključuju dentalnu sondu, analnu sondu i sondu za ranu. Sonde za instrumente mogu se dalje klasificirati prema izgledu i namjeni, kao što su ravna sonda, kuglasta sonda i sonda bubnja. Tvari koje bi mogle poslužiti kao medicinske sonde kreću se od DNK do radioaktivnih izotopa.
Fizički instrumenti sastavljeni od materijala poput čelika, plastike ili stakla čine primarnu većinu pribora za medicinske sonde. Te su naprave obično tanke i izdužene jer se često uvode u male otvore tijela i moraju se lako kretati kroz uske tjelesne šupljine. Stoga se također mogu dizajnirati s određenim stupnjem fleksibilnosti. Specijalizirani proizvođači obično stvaraju medicinske sonde za upotrebu u bolnicama, klinikama i drugim medicinskim ustanovama.
Istraživanje je opća svrha medicinske sonde u većini slučajeva. Ponekad su posebno dizajnirani za određeno područje tijela, poput usta ili anusa. Takve istražne sonde često imaju zatupljen kraj kako bi se izbjegla bilo kakva tjelesna oštećenja i stoga se klasificiraju kao ravne sonde. Druge, poput parodontalne sonde, imaju oštriji i definiraniji kraj za bolji pristup iznimno uskim područjima poput između zuba.
Neki instrumenti medicinske sonde također pružaju važne informacije korisniku. Na primjer, dentalne sonde poput automatizirane sonde, furkatne sonde i Williamsove sonde mogu mjeriti čimbenike poput gubitka kostiju zuba i napredovanja bolesti desni. Sonde za bubanj opremljene su mjerama sondiranja koje mogu pomoći u otkrivanju abnormalnih metalnih čestica, dok Doppler sonde mjere protok krvi. Kuglasta sonda također pomaže u unutarnjim mjerenjima.
U nekim slučajevima, medicinska sonda može pomoći u obavljanju određene funkcije. Sonda za elektroejakulaciju je sama po sebi razumljiva, jer pruža mali tretman šokom donjeg dijela tijela za dobrobit muškaraca. S druge strane, sonde za oči imaju krajeve koji omogućuju pričvršćivanje konca. Neke sonde djeluju kao kateteri koji mogu davati ili drenirati tekućine u tijelu. Osim toga, sonde koje pomažu slanju i primanju valova za ultrazvučne strojeve također se mogu klasificirati kao sonde.
Znanstvenici i medicinski stručnjaci ponekad u tijelo ubrizgavaju tvari koje djeluju kao medicinska sonda. Na primjer, znanstvenici bi mogli manipulirati atomima i jezgrama kako bi stvorili radioaktivne izotope. Određeni procesi također mogu odvojiti niti DNK za korištenje sonde. U takvim slučajevima, tvari se kemijski označavaju i zatim unose u tijelo, gdje pomažu locirati zarazne organizme.