Peptidi su veliki polipeptidni lanci koji se sastoje od do 50 aminokiselina koje se mogu klasificirati prema funkciji i sintezi. Neke uobičajene vrste peptida klasificirane prema funkciji uključuju hormone, neuropeptide i alkaloide. Kada se klasificiraju prema sintezi, peptidi mogu biti ribosomski, neribosomalni i peptonski. Klasifikacijski sustav peptida smatra se nesavršenom znanošću jer jedan peptid može pripadati više skupina istovremeno i znanstvenici nastavljaju raspravljati kada peptid treba klasificirati kao protein ili protein kao peptid. Mnogi znanstvenici se slažu da se peptid ne može lako prilagoditi određenom uzorku, dok je protein po prirodi drugačiji od konformacije.
Hormoni, jedna od najčešćih klasifikacija peptida u ljudskom tijelu, su specifične molekule glasnika koje se koriste u staničnoj komunikaciji. Hormoni su identificirani kao takvi jer ih luče i sintetiziraju specijalizirani timovi stanica, zvane endokrine žlijezde. Nakon izlučivanja, hormonski peptidi putuju do ciljnih organa gdje djeluju. Oblik hormona je specifično povezan s receptorima na staničnim membranama odgovarajućeg ciljnog organa. Na primjer, hormonski peptidi glukagon i inzulin imaju specifična receptorska mjesta u jetri koja im pomažu u kontroli razine šećera u krvi.
Neuropeptidi su široko rasprostranjeni u središnjem i perifernom živčanom sustavu tijela i imaju specifične inhibitorne i ekscitatorne funkcije. Neuropeptidi djeluju na isti način kao i neurotransmiteri poput serotonina i dopamina. Jedna od najpoznatijih klasa neuropeptida su endorfini. Endorfini se smatraju tjelesnim endogenim lijekovima protiv bolova, često se uspoređuju s lijekom morfij.
Dio funkcije endorfina uključuje inhibiciju drugog neuropeptida, supstance P, koja prenosi signale boli iz perifernog živčanog sustava do primatelja u središnjem živčanom sustavu. Ponekad neuropeptidi mogu djelovati i kao hormoni unutar određenih tjelesnih sustava.
Što se tiče klasifikacije peptida zbog njihove sinteze, većina je ribosomskog tipa; ovaj tip peptida se sintetizira kada se translacija ribonukleinske kiseline (mRNA) na stanici. Tijekom prevođenja događa se kemijski proces gdje se jedna karboksilna skupina na aminokiselini spaja s drugom aminokiselinom kako bi se stvorio početak lanca aminokiselina. Ribosomski peptidi se često sastoje od 30 do 40 aminokiselina povezanih zajedno. Neribosomski tip peptida se sintetizira kada su prisutni enzimski katalizatori. Peptonski peptidi su rijetki i nastaju tijekom procesa probave u tijelu.