Postoje mnoge vrste bakterija koje se nalaze u probavnom traktu osobe. Neke su probavne bakterije koje pomažu u procesu probave i osiguravaju dobro zdravlje. Druge vrste bakterija mogu se nastaniti u probavnom traktu i uzrokovati zdravstvene probleme. Među vrstama bakterija koje se nalaze u probavnom traktu su Lactobacillus, Bifidobacterium i Escherichia.
Lactobacillus acidophilus je vrsta bakterije koja živi u tankom crijevu osobe. Smatra se da je to korisna vrsta bakterije iz nekoliko razloga. Ova bakterija sintetizira vitamin K i ima sposobnost metaboliziranja laktoze, vrste šećera koja se nalazi u mliječnim proizvodima. Također proizvodi tvari koje sprječavaju rast i razmnožavanje štetnih bakterija u probavnom traktu. Ako osoba nema dovoljno ove bakterije u svom probavnom traktu, probava može biti poremećena.
Ljudi se često usredotočuju na sposobnost Lactobacillus acidophilusa da ometa rast štetnih bakterija. Ova probavna bakterija također pomaže tijelu u proizvodnji vitamina B skupine. Bakterije također pomažu u održavanju kolesterola na normalnoj razini.
Bifidobakterije su još jedna vrsta prijateljskih bakterija koja se nalazi u probavnom traktu osobe. Živi u čovjekovom debelom crijevu i igra važnu ulogu u zaštiti tijela od nekih vrsta kvasca, kao i bakterija koje su štetne, a ne korisne. Ova bakterija može ometati bakterije koje upale crijeva i uzrokuju da oboljela osoba doživi proljev. Djeluje tako da ometa sposobnost bakterija da raste. Također može pomoći tijelu da proizvodi vitamin B.
Streptococcus thermophilus je probavna bakterija koja pomaže tijelu u stvaranju enzima laktoze. Ovi enzimi važni su za probavu mliječnih proizvoda. Ova bakterija također pomaže zaštititi gastrointestinalnu sluznicu osobe kada mlijeko i mliječni proizvodi prolaze kroz probavni proces. Zapravo, za ovu bakteriju se čak kaže da pomaže ljudima da izbjegnu neugodne simptome netolerancije na laktozu.
Mnogi ljudi su čuli za Escherichia coli, koja se obično skraćeno naziva E. coli. Ova vrsta bakterija često je krivac kada netko razvije probavne bolesti, poput onih koje uzrokuju povraćanje i proljev. Escherichia coli je cijela skupina bakterija, međutim, a neke od njih su prijateljske. Neki sojevi ove probavne bakterije pomažu tijelu da probavi biljnu hranu. Neki također pomažu tijelu da proizvodi vitamin K.