Postoji niz problema koji se mogu pojaviti kao rezultat ugradnje zubnih implantata. Na primjer, infekcija se može pojaviti oko mjesta implantata. Loše postavljanje implantata također može uzrokovati bol i oštećenje živca. Ako implantat nije pravilno postavljen, može biti i labav ili nestabilan. U nekim slučajevima može se slomiti i treba ga zamijeniti, ili ga tijelo čak može odbiti.
Jedan od prilično čestih problema sa zubnim implantatima je infekcija. Bakterije se mogu nakupiti u desni oko implantata, uzrokujući bol, oticanje i upalu. Zubi oko implantata također mogu biti zahvaćeni, a u nekim slučajevima infekcija može uzrokovati gubitak kostiju u čeljusti. Kada se to dogodi, područje je obično potrebno očistiti i tretirati antiseptičkom tekućinom za ispiranje usta ili antibioticima; u teškim slučajevima, implantat će možda trebati ukloniti kako bi se infekcija mogla očistiti i zacijeliti.
Još jedna od vrsta problema sa zubnim implantatima koja se može dogoditi je kada je zahvaćen živac u čeljusti. Ako se implantat postavi na živac ili blizu njega, može izvršiti pritisak na njega, što rezultira bolom ili oštećenjem. Implantate koji su nepravilno postavljeni na ovaj način obično je potrebno ukloniti i ponovno postaviti na prikladnije mjesto.
Implantat koji nije čvrsto postavljen u kost također može biti klimav i labav; to se može dogoditi iz raznih razloga. Na primjer, početna operacija možda nije bila ispravno izvedena ili količina kosti u koju je implantat umetnut možda nije bila dovoljna da ga zadrži stabilnim. Pretjeran pritisak na implantat od strane drugih zuba također ga može olabaviti. S ovim vrstama problema sa zubnim implantatima, situaciju je potrebno procijeniti i riješiti kako bi se implantat čvršće učvrstio.
Potpuni neuspjeh implantata još je jedan od potencijalnih problema sa zubnim implantatima. Metal koji se koristi za izradu implantata, obično titan, može se saviti, pa čak i slomiti. Iako to nije iznimno često, kada se implantat pokvari, stomatolog ga mora zamijeniti novim.
Zubni implantat je strani predmet koji se umetne u čeljust, a ponekad će ga tijelo pacijenta odbiti. Tijelo ga smatra uljezom i stoga ga ne želi prisutan. U tim slučajevima, pacijentovo vlastito tijelo može zapravo istisnuti implantat. Pacijenti u ovoj situaciji možda će morati razmotriti druge mogućnosti jer će njihovo tijelo vjerojatno odbiti daljnje pokušaje ugradnje implantata.