Softver administratora sustava obično uključuje širok raspon programa za praćenje djelovanja na sustavu i odgovor na događaje ili probleme koji se pojave. Uobičajeni programi uključuju alate koje administrator može koristiti za preuzimanje kontrole nad udaljenim terminalom i softver za upravljanje računima i lozinkama. Postoje vrste softvera za administratore sustava koji se koriste kao alati za sigurnosno kopiranje i oporavak, za zaštitu podataka i programi za osiguranje zaštite od zlonamjernog softvera. Ostali alati mogu uključivati uslužne programe za postavljanje i nadzor mreža i kontrolu pristupa njima.
Mnogi softverski programi administratora sustava razvijeni su kao alati za rad s računalima koja su dio mreže. U tom svojstvu, programi udaljene radne površine mogu biti prilično učinkoviti. Ova vrsta softvera omogućuje administratoru da preuzme kontrolu nad računalom na mreži i rješava probleme kroz program. Takav softver administratora sustava može čak omogućiti potpunu kontrolu tipkovnice i miša, kao da administrator zapravo sjedi na udaljenom terminalu.
Također postoje mnogi programi dizajnirani za dodjelu i kontrolu nad računima u sustavu. To može uključivati softver administratora sustava koji se koristi za brzo stvaranje i distribuciju korisničkih imena i postavljanje zadanih lozinki. Mogu biti uključene dodatne kontrole sigurnosti i lozinke, kao što su programi koji skeniraju lozinke kako bi pronašli one koje su slabe ili ugrožene i šalju obavijest administratoru.
Mnogi alati i programi razvijeni su za sigurnosno kopiranje i oporavak podataka na sustavu. Takav softver administratora sustava može brzo napraviti disk za oporavak ili napraviti punu sliku diska kao sigurnosnu kopiju. Administratori također koriste uobičajene programe poput antivirusnog softvera i filtara za neželjenu poštu kako bi osigurali sigurnost računala koja su dio mreže. Ova vrsta softvera administratora sustava može biti slična jednostavnijim verzijama zaštitnih programa, ali može skenirati brojne sustave istovremeno i prenositi informacije o njima zajedno.
Postoje i programi za postavljanje mreža, uključujući lokalne i veće mreže koje se povezuju na Internet i poslužitelje izvan lokalnog područja. Softver administratora sustava može se koristiti za testiranje mrežnih veza i za pregled dolaznih i odlaznih podataka kako bi se potražili pokazatelji napada ili zlonamjernog softvera unutar mreže. Administrator također može pokrenuti testove na mreži, zvane testovi penetracije, kako bi potražio terminale ili portove na mreži koji bi mogli biti ranjivi na napad. Za veće sigurnosno testiranje mogu se koristiti i drugi alati, kao što su programi koji pokreću napad na mrežu ili pokušaju hakiranja lozinke.