Različite vrste ugroženih kornjača mogu se podijeliti u dvije glavne skupine. Morske ili morske kornjače suočavaju se s ozbiljnim prijetnjama u našim oceanima i na kopnu zbog uništavanja mjesta gniježđenja i komercijalnog ribolova. Slatkovodne kornjače, osobito u Aziji, također su u opasnosti od izumiranja zbog gubitka staništa i ilegalne trgovine. Nekoliko agencija i organizacija diljem svijeta radi na poboljšanju izgleda ovih vrsta za opstanak.
Šest od sedam vrsta morskih kornjača navedene su kao ugrožene ili ugrožene prema Zakonu o ugroženim vrstama (ESA). Te vrste su glavate kornjače, zelene kornjače, Kempove ridley kornjače, kožnate kornjače, kornjače sa kljunom i maslinaste kornjače. Iako ove ugrožene kornjače žive u oceanu, pare se i polažu jaja na kopnu. Mjesta koja često koriste u tu svrhu bila su podložna uništavanju staništa, što kornjačama otežava pronalaženje prikladnih alternativa gdje se njihova jaja mogu sigurno izleći. Drugi uzroci opadanja populacije morskih kornjača uključuju udare čamcima, hvatanje komercijalnim ribolovom i zarobljavanje u krhotinama.
Budući da ove vrste morskih kornjača obitavaju u vodama SAD-a, Nacionalna služba za morsko ribarstvo (NMFS) i US Fish and Wildlife Service (FWS) aktivno su uključeni u očuvanje ovih vrsta. NMFS se bavi naporima očuvanja s ciljem smanjenja broja kornjača pogođenih plovnim objektima i ulovljenih u ribolovu. FWS pruža zaštitu i napore oporavka za mjesta gniježđenja ovih ugroženih kornjača. ESA ovim vrstama daje dodatnu pravnu zaštitu.
Vrste slatkovodnih kornjača diljem svijeta pogođene su uništavanjem staništa i drugim uzrocima smanjenja populacije. Ovaj problem je glavna briga za nastavak postojanja slatkovodnih kornjača u Aziji. Sve vrste koje se javljaju u ovoj regiji smatraju se ugroženim ili ugroženim. To uključuje vrste kao što su crna ribnjačka kornjača, četverooka kornjača, malezijska divovska kornjača, žuto obrubljena kornjača i kornjača s košticama.
Glavne prijetnje ovim ugroženim kornjačama su ilegalna trgovina divljim životinjama, degradacija staništa i lov. Slatkovodne kornjače često se hvataju i prodaju na tržnicama za meso, lijekove i trgovinu kućnim ljubimcima, iako postoje zakoni koji zabranjuju te aktivnosti. Lovci u južnim dijelovima Azije također ih hvataju kako bi prehranili svoje lokalno stanovništvo. Mnoga područja koja nastanjuju slatkovodne kornjače uništena su šumskim požarima ili pretvorena u poljoprivredno zemljište.
Organizacije poput Svjetskog fonda za divlje životinje, Međunarodne unije za očuvanje prirode i Saveza za preživljavanje kornjača ulažu napore kako bi osigurale strožiju provedbu zakona koji štite slatkovodne kornjače od ilegalne trgovine. Ostale mjere očuvanja uključuju pronalaženje ili stvaranje sigurnih staništa. Ove organizacije također služe kako bi više ljudi upoznalo s prijetnjama za ove vrste.