Od preko 450 vrsta morskih pasa u svijetu, njih oko 200 smatra se ugroženim od strane Međunarodne unije za očuvanje prirode (IUCN). Više od 100 vrsta morskih pasa ljudi komercijalno iskorištavaju, što dodatno pridonosi njihovoj ugroženosti. Zapravo, neke populacije vrsta morskih pasa smanjile su se za više od 90% posljednjih godina, uglavnom dijelom zbog ljudskih aktivnosti.
Prvih deset najugroženijih morskih pasa, od najmanje do najugroženije, su:
morski pas Borneo, Carcharhinus borneensis
bijeli morski pas, Hemitriakis leucoperiptera
glupi morski pas, Centrophorus harrissoni
morski pas bodež, Isogomphodon oxyrhynchus
prugasti pas, Mustelus fasciatus
morski pas anđeo, Squatina squatina
morski morski pas iz Nove Gvineje, Glyphis sp. nov. C
riječni morski pas Bizant, Glyphis sp. nov. A
morski pas Pondicherry, Carcharhinus hemiodon
morski pas Gagnes, Glyphis gangeticus
Jedna od primarnih prijetnji ugroženim morskim psima je prekomjerni ribolov. Mnogi od najugroženijih morskih pasa su prekomjerno izlovljeni, uključujući bijelopereg morskog psa, morskog psa bodeža i riječnog morskog psa Bizant. Morski psi su komercijalno traženi za svojim perajama i hrskavicom. U dijelovima Azije juha od peraja morskog psa smatra se delikatesom, dok mnogi vjeruju da hrskavica morskog psa ima zdravstvene prednosti, uključujući borbu protiv raka, liječenje artritisa i jačanje imuniteta. Ove tvrdnje trenutno nisu potkrijepljene snažnim znanstvenim dokazima, međutim, mnogi morski psi možda umiru uzalud.
Drugi čimbenik koji prijeti mnogim ugroženim morskim psima, uključujući bijelopereg morskog psa i riječnog morskog psa Bizant, je uništavanje staništa. Mangrove su podvodna obalna područja koja mnoge vrste morskih pasa obično koriste kao uzgajalište. To su područja vegetacije duž obale i mogu se smatrati podvodnim šumama. U mnogim dijelovima svijeta ljudi uništavaju mangrove kako bi napravili mjesta za akvakulturu ili uzgoj vodenih vrsta. Kao rezultat toga, mnogim morskim psima nije mjesto previše pasmine, a činjenica da imaju niske stope reprodukcije samo pogoršava problem.
Morski psi se ubijaju mnogo više nego što se mogu razmnožavati. Općenito, morskim psima treba mnogo godina da dostignu spolnu zrelost i obično rađaju nekoliko potomaka odjednom. Ako se nastave klati sadašnjom stopom, očekuje se da će neke vrste izumrijeti u sljedećem desetljeću. Na primjer, populacija morskog psa nijemog gutača smanjila se za 99% u posljednjih nekoliko desetljeća, a moguće je da manje od 250 jedinki postoji u vrstama morskih pasa u Novoj Gvineji i Bizant. Od 2010. zaštitnici prirode i zagovornici morskih pasa rekli su da se moraju poduzeti kritične i neposredne mjere u ime ugroženih morskih pasa kako bi se osigurao njihov opstanak.