Prijenosno i stolno računalo razlikuju se po veličini i funkcionalnosti. Laptop je mnogo manji i stoga je često praktičniji za korištenje. Stolno računalo je puno veće i obično traje mnogo dulje od prijenosnog računala prije nego što ga treba popraviti ili zamijeniti. Prijenosno računalo je često samostalna jedinica i za njegovo pokretanje nisu potrebni dodatni dijelovi. Korisnici često moraju kupiti monitore i drugu dodatnu opremu za rad sa stolnim računalom. Postoji mala ili nikakva razlika u vrstama softvera koji se mogu pokretati na svakoj vrsti računala.
Veličina je najuočljivija razlika između prijenosnog i stolnog računala. Prijenosno računalo je jedan stroj s tvrdim diskom, diskovnim pogonom, monitorom, bežičnim modemom, tipkovnicom i mišem koji se nalazi unutar njega i lako se sklapa za spremanje u torbicu. Jedini dodatni pribor koji je često potreban je kabel za napajanje na koji je priključen adapter. Stolno računalo sastoji se od tornja, koji je velika pravokutna kutija. Hardver za računalni sustav nalazi se u kutiji. Vanjski monitor, tipkovnica, miš i bežični usmjerivač često moraju biti spojeni na računalo kako bi mogli u potpunosti raditi.
Način na koji se napajaju prijenosni i stolni računalni sustav je još jedna razlika. Laptop radi na punjivu bateriju. Korisnik često mora uključiti prijenosno računalo u izvor napajanja kako bi napunio bateriju. Laptop se može koristiti samo dok se baterija ne isprazni, a u tom trenutku vlasnik mora pronaći izvor napajanja kako bi ga uključio. Stolno računalo radi putem izravnog izvora napajanja. Nakon što vlasnik pronađe prikladno mjesto za postavljanje računala, ono se uključuje u zidnu utičnicu i često ostaje na istom mjestu do kraja upotrebe.
Način održavanja i nadogradnje prijenosnog i stolnog računala je drugačiji. Ako vlasnik želi nadograditi svoje stolno računalo, može instalirati novi izvor napajanja, grafičku karticu, zvučnu karticu, tvrdi disk, dodatni RAM ili drugi hardver s vrlo malo tehničkog znanja. To se često može učiniti mnogo jeftinije od troškova odnošenja računala u radionicu. Laptop je, s druge strane, puno teže nadograditi. Većem dijelu unutarnjeg hardvera u prijenosnom računalu često je teško pristupiti, ukloniti i zamijeniti. Zbog toga je trošak popravka ili nadogradnje prijenosnog računala često mnogo skuplji od obavljanja istog zadatka na stolnom računalu.