Glavni čimbenici koji određuju dozu hidrokortizona su vrsta i težina bolesti koja se liječi te veličina pacijenta. Što je pacijent veći, to će biti potrebno više lijeka za postizanje željene razine u krvi. Kao posljedica toga, odraslima se propisuju mnogo veće doze od djece. Doziranje će se razlikovati po načinu primjene kao i po veličini. Akutni poremećaji opasni po život zahtijevat će intramuskularnu ili intravensku injekciju, dok se neakutne bolesti mogu liječiti oralnim dozama. Za liječenje kožnih bolesti primjenjuje se i lokalno kroz hidrokortizonsku kremu ili mast, a za ublažavanje kolitisa može se davati rektalno u obliku suspenzije.
Jedno od stanja za koje se ovaj lijek koristi je adrenokortikalna insuficijencija, što je neuspjeh nadbubrežnih žlijezda da proizvode dovoljno steroidnih hormona. Doza hidrokortizona za odrasle je 100 mg intravenozno, nakon čega slijedi 300 mg dnevno ili u segmentiranim količinama ili kao 48-satna infuzija. Kada se odrasli pacijent poboljša, doza će se prebaciti na oralnu, 50 mg tri puta na dan, a kasnije se smanjuje na 30 do 50 mg jednom dnevno. Maloj djeci s ovim stanjem u početku će se intravenozno davati 1 do 2 miligrama/kilograma (mg/kg), a kasnije će se doza smanjiti na 25 do 100 mg dnevno u segmentiranim količinama. Starijoj djeci u početku će se dati injekcija hidrokortizona, a zatim će se kasnije prepisati oralna doza od 30 do 50 mg dnevno u podijeljenim količinama.
Odrasla doza hidrokortizona za upalu može se primijeniti intravenozno, bilo intramuskularno ili oralno. Obično se propisuje 15 do 240 mg dnevno. Preporučene oralne doze za malu djecu s upalom su 2.5 do 10 mg/kg dnevno u segmentiranim količinama. Intravenske ili intramuskularne doze za ovu dobnu skupinu obično su 1 do 5 mg/kg dnevno. Protuupalna doza za stariju djecu je oralna, intramuskularna ili intravenska primjena od 15 do 240 mg dva puta dnevno.
Još jedna bolest koju ovaj lijek koristi za liječenje je šok, što je hitno stanje koje proizlazi iz neadekvatnog protoka krvi unutar tijela. Tipična doza hidrokortizona za odrasle je 500 mg do 2 grama (g) koja se daje intravenozno, četiri do 12 puta dnevno. Djeci u šoku daju se dvije početne doze od 50 mg/kg intravenozno, u razmaku od četiri sata. Doza za dijete se kasnije smanjuje na jednom dnevno, prema potrebi. Adolescentima u šoku propisuje se 500 mg do 2 g, četiri do 12 puta dnevno.
Astma, koja je poremećaj koji uključuje dišne putove, može se liječiti hidrokortizonom. Doza hidrokortizona za odrasle je obično 100 do 500 mg intravenozno, četiri puta dnevno. Liječenje djece s akutnom astmom može uključivati udarnu dozu od 4 do 8 mg/kg intravenozno. Doza održavanja za dijete je 2 mg/kg, četiri puta dnevno.
Ulcerozni kolitis, upalno stanje koje zahvaća debelo crijevo, može se ublažiti ovim lijekom. Doziranje hidrokortizona za odrasle je uobičajeno davanje 100 mg rektalne suspenzije svake noći tijekom 21 dana. Teškim slučajevima bolesti mogu biti potrebna dva do tri mjeseca liječenja. Ako je trajanje ove terapije dulje od 21 dana, potrebno ju je polako prekinuti smanjenjem doze hidrokortizona na jednom svakih 48 sati u trajanju od dva do tri tjedna.