Cijena pozitronske emisijske tomografije (PET) može značajno varirati među ustanovama za ispitivanje. Postoje neki glavni čimbenici koji utječu na ukupnu cijenu PET skeniranja, uključujući tehničke naknade, naknade za laboratorije i naknade za radiofarmaceutske lijekove FDG. Pacijenti, međutim, obično mogu uštedjeti novac ako uspoređuju ponude prije nego što se podvrgnu proceduri jer se sva tri faktora mogu razlikovati među ustanovama za testiranje. Osim toga, lokacija objekta za testiranje također može utjecati na konačnu cijenu PET skeniranja. Od ovih glavnih čimbenika, postoje različiti sudionici koji mogu utjecati na pojedinačne troškove povezanih naknada kao i na ukupne troškove.
Tehničke naknade obično pridonose većem dijelu troškova povezanih s PET skeniranjem. Uzimajući u obzir troškove izvođenja PET skeniranja, na tehničke naknade utječu brojni suradnici. Uzimajući u obzir vrstu skeniranja i vrstu opreme koja se koristi, oboje su vrlo važni za troškove tehničkih naknada. Istraživanje poslovne analize pokazuje da postoje značajne promjene troškova povezanih s različitim modelima PET skenera. U rasponu od početnih troškova i tekućeg održavanja opreme u postrojenju za testiranje do potrebne obuke osoblja za učinkovito korištenje opreme, korisnost opreme čini veliku razliku u troškovima koji se često odražavaju u naknadi za tehničke naknade.
Sami zahtjevi za skeniranje također će negativno utjecati na cijenu PET skeniranja. Na primjer, skeniranje male regije tijela obično traje manje vremena i resursa. Stoga takvi zahvati nisu toliko skupi kao opsežnije skeniranje. Ponekad čak i za veliko skeniranje, troškovi korištenja PET-a za razliku od invazivne kirurgije mogu biti značajna strategija smanjenja troškova, osobito ako skeniranje može pomoći liječnicima da točno dijagnosticiraju bolest. Ovu mogućnost pacijenti će morati uzeti u obzir pri određivanju tvrdih i mekih troškova.
FDG radiofarmaceutske naknade i naknade za laboratorij također se dodaju ukupnom postupku ili čak naplaćuju kao zasebne stavke, ali oboje su još uvijek dio ukupnog troška PET skeniranja. Radiofarmaceutski FDG je radioaktivni element koji se ubrizgava u pacijenta prije podvrgavanja PET skeniranju; kako postrojenje za testiranje dobiva FDG i kako se pohranjuje do upotrebe može napraviti veliku razliku u temeljnim troškovima koji se pojavljuju pored ove stavke. Naknade za laboratorij su još jedna stavka koju treba uzeti u obzir, a koja se odnosi na radiolog koji tumači rezultate. Iako su možda dosljednije među ustanovama za testiranje od ostalih naknada, još uvijek postoje razlike. Lokacija ustanove za testiranje može utjecati na sve te povezane naknade i često se pojavljuje u laboratorijskoj naknadi, s tim da gradski objekti često naplaćuju manje zbog većeg broja pacijenata koji redovito pristupaju PET uslugama.