Pupkovina povezuje fetus ili embrij u razvoju s majčinom posteljicom. Nakon rođenja, pupkovina se presiječe, a mali dio ostaje pričvršćen za djetetov pupak. Između sedam dana i 12 tjedana nakon rođenja, obično, ovaj dio pupkovine otpada sam. Neki čimbenici koji mogu dovesti do kašnjenja u odvajanju pupkovine uključuju korištenje antiseptika, imunodeficijencije, carski rez, nedonoščad i neonatalnu sepsu.
Prilikom rođenja djeteta, pupčana vrpca će biti stegnuta i odrezana ne više od oko 1.2 cm (3 inča) od djetetova trbuha. Održavanje pupkovine čistom i suhom važno je zbog njezine mogućnosti da bude izvor infekcije za bebu. To se može postići korištenjem neparfimiranog sapuna i čiste vode. Prekomjerna upotreba antibiotika ograničit će normalnu kolonizaciju pupka korisnim bakterijama, što će dovesti do odgode odvajanja pupkovine.
Nedostatak adhezije leukocita je poremećaj imunodeficijencije koji utječe na fagocitne krvne stanice. Jedan od učinaka ovog poremećaja je da uzrokuje kašnjenje u odvajanju pupkovine dojenčadi. Teški slučajevi ovog poremećaja mogu se liječiti alogenom transplantacijom koštane srži.
Urahalne anomalije također mogu uzrokovati kašnjenje u razdvajanju. Urahus povezuje kupolu mokraćnog mjehura embrija s pupkovim prstenom. Ako se pupkovina ne zatvori pravilno, to može dovesti do stvaranja urahalne ciste i odgoditi odvajanje.
Infekcija panja pupkovine ili tkiva koja ga okružuju poznata je kao omfalitis. Ovo stanje najvjerojatnije će zahvatiti novorođenčad nakon pet do devet dana, ili čak i ranije za prijevremeno rođene bebe. Jedan od čimbenika koji dovode do omfalitisa je nedostatak pravilne higijene tijekom poroda, a jedna od posljedica je kašnjenje u odvajanju pupkovine.
Prijevremeno rođene bebe imaju veći rizik od odgođenog odvajanja pupkovine u usporedbi s donošenim bebama. Jedan od razloga za to je smanjenje normalne bakterijske kolonizacije pupka.
Neonatalna sepsa je uzrokovana infekcijom krvi dojenčadi mlađe od 90 dana. Beba se može zaraziti infekcijom od majke tijekom ili prije poroda. Simptomi ove infekcije uključuju natečeni trbuh, proljev, napadaje i kašnjenje u odvajanju pupkovine.
Može potrajati dulje da se pupkovina odvoji kod dojenčadi koja su rođena carskim rezom u usporedbi s dojenčadi koja je rođena vaginalno. Razlog tome je sterilna priroda carskog reza. To inhibira normalnu kolonizaciju pupkovine korisnim bakterijama koje pomažu u odvajanju.