Na dovoljnu pedijatrijsku dozu amoksicilina utječu mnogi čimbenici, uključujući specifično stanje koje se liječi, dob pacijenta, težinu pacijenta i njihov odgovor na liječenje. Na primjer, pedijatrijski bolesnici koji se liječe od upale srednjeg uha u dobi između četiri mjeseca i 12 godina zahtijevaju 20 do 50 miligrama (mg) po kilogramu (kg) težine svaki dan. Ako se bolesnik liječi radi profilakse antraksa, preporučena doza raste na 80 mg po kg težine dnevno. U većini slučajeva, potrebna pedijatrijska doza amoksicilina izražava se kao raspon koji se odnosi na težinu pacijenta i njegov ili njezin odgovor na lijek.
Težina je najčešći čimbenik u određivanju dovoljne pedijatrijske doze amoksicilina. Većim pacijentima potrebne su veće doze lijeka kako bi se postigao isti učinak. Iz tog razloga, većina doza je izražena po kg težine. To znači da će pacijent težine 50 kg dobiti otprilike dvostruko veću dozu od one koju će primiti bolesnik od 25 kg. Varijacije u težini mogu stoga uzrokovati značajne razlike u doziranju.
Drugi čimbenik koji može utjecati na pedijatrijsku dozu amoksicilina je pacijentov odgovor na lijek. Neki pacijenti mogu imati prirodnu otpornost na mnoge lijekove, a liječnici se mogu odlučiti povećati dozu koja se daje tim pacijentima. Zbog toga je većina pedijatrijskih količina amoksicilina navedena kao raspon. Na primjer, doza potrebna za upalu pluća može biti između 40 i 50 mg po kg težine. Specifična doza unutar ovog raspona određena je uočenim učincima lijeka na pojedinca.
Različita stanja također zahtijevaju drugačiju dozu amoksicilina za djecu. Ako se bolesnik u dobi od četiri mjeseca do 12 godina liječi od upala krajnika, potrebna doza je između 20 i 50 mg po kg dnevno. Pacijent iste dobi koji se liječi za profilaksu antraksa primat će dozu od 80 mg po kg dnevno. To je zato što različita stanja reagiraju na različite količine penicilinskih antibiotika.
Neka stanja imaju različite zahtjeve za pedijatrijskom dozom amoksicilina na temelju dobi pacijenta. Na primjer, pacijent u dobi od četiri tjedna do tri mjeseca koji se liječi od infekcije mokraćnog sustava primat će između 20 i 30 mg amoksicilina. Pacijentu između četiri mjeseca i 12 godina može se dati bilo što između 20 i 50 mg lijeka. To je zato što su stariji pacijenti otporniji na liječenje lijekovima.